Efter Shaggys onkel Beaureguards død ankommer han, Scooby og Scrappy til sin onkels plantage for at samle arven. Men så snart de ankommer, opdager de, at den er hjemsøgt af en konfødereret soldats spøgelse. Med denne uhygge på halen, mens de leder efter Shaggys arv, hyrede de Boo Brothers, en trio af spøgelsesudryddere, til at hjælpe med at fange denne grimme spøgelse.
En forfatter får til opgave at skal prøve at finde identiteten på den person der hjælper med at opfylde de ønsker der placeres på engeltræet i hendes barndomsby, for at få en fast artikel plads på hendes arbejde og i processen genforbindes med sin barndomsven og en by der gør alt for at holde på hemmeligheden.