Nu Kai verslagen is, hervatten Ryotaro en de rest van de DenLiner-crew hun tijdreisavonturen door een detectivebureau op te richten om alle andere overlevende Imagin onder controle te houden. Maar wanneer een bedrieglijke Imagin de reserve Den-O Pass van de eigenaar steelt, is het aan de DenLiner-politie en de beginnende detective Kazuya, samen met een beetje hulp van een andere Rider, om de kwaadaardige Imagin te stoppen en het verleden, het heden en de toekomst te redden!
Terwijl een computervirus gebaseerd op Pac-Man Japan binnendringt, valt een groep artsen Genm Corp aan en begint een golf van terreur met behulp van gestolen Proto Gashats. Ghost en Ex-Aid bevinden zich in het middelpunt van de strijd in een poging degenen die voor hen het belangrijkst zijn te beschermen. Maar ze zijn niet de enigen: Heisei Riders uit het verleden sluiten zich bij hen aan om Dr. Pac-Man tegen te houden!
Japan wordt aangevallen door Godzilla, die na zijn mislukte aanval van vijftig jaar geleden op wraak zint. Godzilla is bestand tegen praktisch alle conventionele wapens, en uiteindelijk lijkt Godzilla alleen te verslaan door drie heilige monsters, die tot leven worden gewekt door de aanbidding van de zielen van in de tweede wereldoorlog omgekomen Japanse soldaten.
Asumu Adachi stelt zich voor dat hij zou kunnen zijn als Kamen Rider Hibiki, en wordt benaderd door pratende Disc Dieren die hem leren hoe hij als Hibiki moet zijn, waardoor Asumu uiteindelijk kan transformeren in Kamen Rider Armed Hibiki.
Dertig jaar na zijn eerste aanval keert Godzilla terug om Tokio voor de zoveelste keer in zak en as te leggen. Deze keer heeft de mensheid echter een gepast wapen tegen het monster: de hyper-geavanceerde straaljager Super X.
Uitvinder Goro Ibuki creëert een mensachtige robot genaamd Jet Jaguar. Het wordt al snel in beslag genomen door een onderzees ras van mensen genaamd de Seatopians. Met Jet Jaguar als gids sturen de Seatopians Megalon als wraak voor de kernproeven die hun samenleving hebben verwoest.