Ashitaka bliver bidt af en dæmon og får en grim infektion. Derfor begiver han sig afsted for at finde guden Shishigami, der efter sigende kan helbrede ham. Undervejs oplever han den åbne konflikt mellem skovens gamle guder. Han er også vidne til minelandsbyens udnyttelser af jordens ressourcer. Ashitaka prøver at mægle, men uden større held.

Grupper af nyligt afdøde mennesker, som er blevet genoplivet og udstyret med højteknologiske våben, må samarbejde for at overvinde en monsterhær i Tokyo og Osaka.

Bygger på historien bag det populære spil "Final Fantasy VII". Der er nu gået to år, siden Midgar blev omdannet til den ruin, der står som mindesmærke over de ofre, freden kostede. Men nu står verden over for en ny katastrofe. En mystisk sygdom spreder sig med lynets hast, og gamle fjender begynder igen at røre på sig. Derfor må Cloud, som lagde sit helteliv bag sig for at leve i ensomhed, endnu en gang træde ind i arenaen...

Mewtwo er flyver med en gruppe af Flying-typen Pokémon over en bjergkæde, og senere, havet. Beslutter at udfordre grænserne for sin magt, Mewtwo flyver fremad, Mega udvikle sig til Mega Mewtwo Y og stigende i himlen. I mellemtiden Genesect hær ankommer til et snedækket område, at deres leder, en rød Genesect, mener at være deres hjem. Forvirret og bedrøvede, det Genesect bærer slukke Drive råber "Jeg vil hjem."