Una batalla sense parió assola el Japó amb la sobtada aparició d'un home misteriós. Un home apareix amb la intenció de substituir l'All Might i ser un nou símbol. I tot que crida als quatre vents que ara és el seu torn, es tracta d'en Dark Might! Tot i assemblar-se físicament a l'All Might, els ideals d'en Dark Might no podrien ser més diferents. Fa servir el seu do en benefici propi i crea una enorme fortalesa que comença a absorbir la població civil. Entre el grup que acompanya en Dark Might hi ha l'Anna, una noia amb un do desconegut que és al punt de mira d'en Giulio, individu estoic vestit de majordom. Ell l'anomena "senyoreta Anna", i sembla que va darrere la seva vida. Quina connexió deu tenir amb en Dark Might?

Després que un misteriós presoner amb només unes setmanes de condemna surti de la presó a Central City, els germans Elric l'intenten localitzar. La recerca els porta a Table City, al país sud-oest de Creta, on l'Alphonse rescata la Júlia, una jove alquimista, del mateix home que estan intentant capturar. Enmig de la baralla s'endinsen al territori de la Júlia, els barris marginals de la vall de Milos, i es veuen implicats en la rebel·lió popular de la seva gent.