In dit langverwachte vervolg moet Marty met Doc Brown naar de toekomst reizen om zijn toekomstige zoon uit de problemen te helpen. Zonder dat ze het weten 'leent' Marty's aartsrivaal Biff Tannen de tijdmachine om een kalender met sportuitslagen naar zijn vroegere ik in 1955 te brengen.
In de toekomst vindt er een wereldoorlog plaats tussen de mensen en de machines. De machines sturen een Terminator terug in de tijd. Deze cyborg heeft maar één missie: het doden van Sarah Connor, omdat haar ongeboren zoon zal uitgroeien tot de leider van het menselijk verzet.
Doc Brown is in 1885 gestrand en Marty gaat weer terug in de tijd om hem te redden. Helaas raakt de benzine van de DeLorean op en moeten ze een andere manier verzinnen om terug naar de toekomst te komen.
Na het succes van de Dawn Rebellion onderhandelt Degwin met vice-admiraal Revil over het inleveren van alle bezittingen van de Federatie en de volledige terugtrekking van de Federatie-troepen uit Side 3 om te voorkomen dat soortgelijke incidenten zich opnieuw voordoen. Nadat hij door Degwin is berispt omdat hij niet voor Garma heeft gezorgd, stuurt Dozle Char - die Garma motiveerde om de rebellie te beginnen - naar de aarde; als reactie hierop vraagt Char om piloot van een mobiel pak te worden als hij terugkeert. Dozle voelt de last van zijn verantwoordelijkheden en stelt voor om Zenna Mia te cadetten. In de aardse stad Manaus krijgt Char een baan als piloot voor mobiele werknemers op een bouwplaats. Hij ontmoet een jonge Lalah Sune in een casino.
Het ruimteschip 'Enterprise E' patrouilleert aan de rand van ons sterrenstelsel, wanneer de bemanning een noodboodschap van het hoofdkwartier van de Starfleet ontvangt: de Borg, een uiterst oorlogszuchtig buitenaards volk, zijn de ruimte van de Federatie binnengedrongen en stevenen af op de aarde.
John Sullivan pakt op een dag de oude radio van zijn vader en gaat er een beetje mee spelen. Ineens krijgt ie contact met zijn overleden vader, die dertig jaar terug leeft. John weet op deze manier het leven van zijn vader, die omgekomen is bij een brand, te redden.
In de ruimte worden signalen opgevangen van walvissen die op aarde allang uitgestorven zijn. Door de signalen die ze uitzenden, treden er storingen op in ruimtestations. Eén van de leden van de Enterprise komt op het idee om terug in de tijd te reizen en dan twee walvissen te vangen. Deze walvissen moeten reageren op de signalen anders zal de defensie van de Starfleet machteloos zijn. Captain T. Kirk, dr. Spock en nog een paar andere leden van de Enterprise krijgen een niet zo'n gemakkelijke missie, want het schijnt dat er niet zoveel walvissen meer op aarde zijn.
Geppetto maakt een houten pop en noemt hem Pinocchio. Zijn wens dat Pinocchio een echt jongetje zal zijn wordt door een fee waarheid gemaakt. Ze wijst de krekel Jiminy aan om als Pinocchio's geweten op te treden en hem uit de problemen te houden.
Momo is een natuurkind. Ze woont in een oude ruïne buiten de stad, zonder vader of moeder. Maar ze is niet vaak alleen. Veel mensen en kinderen komen bij haar op bezoek, want Momo kan goed luisteren. Daardoor heeft ze veel echte vrienden. Dat verandert vanaf het moment dat de grijze heren opduiken, de tijdspaarders. Die zetten iedereen aan om tijd niet te verdoen met 'nutteloze' dingen; het komt erop aan dat je in het leven iets bereikt en dat je veel spullen hebt. Voor vriendschap en spelen is geen tijd meer. Het leven verkilt, wordt gehaast en vreugdeloos. De tijdspaarders krijgen iedereen in hun macht, behalve Momo.
De Romeinen willen hun rijk uitbreiden. Het lijkt erop dat de Galliërs meer problemen dan gebruikelijk hebben om weerstand te bieden aan de soldaten van Caesar, nu Panoramix zijn geheugen kwijt is nadat hij een menhir op z'n kop heeft gekregen. Obelix heeft per ongeluk een menhir op het hoofd van de druïde Panoramix gegooid. Panoramix is daardoor stapelgek geworden en kan zich het recept van de toverdrank niet meer herinneren. Dan krijgt het dorp, onbeschermd door de toverdrank, bezoek van een Ziener die handig inspeelt op de grootste angst van de Galliërs,namelijk dat de hemel op hun hoofd zou kunnen vallen. Er ontstaat angst en twist onder de anders zo onverschrokken dorpelingen. Tot overmaat van ramp krijgen ook de Romeinen daar lucht van.
In de verre toekomst probeert de mensheid een milieuramp die de wereld bijna fataal is geworden teniet te doen door geavanceerde apparaten, vermomd als 20e-/21e-eeuws speelgoed, terug in de tijd te sturen. Een aantal van deze speeltjes belanden in handen van twee kinderen: Noah en Emma, die met hun ouders, Jo en David, in het Seattle van begin 21e eeuw wonen. Emma is vooral geobsedeerd door een speelgoedkonijn, dat ze Mimzy noemt.
In een anti-radar experiment verdwijnt een marineschip in 1943 spoorloos van de marinebasis in Philadelphia. Twee matrozen van het schip worden 40 jaar de toekomst in geworpen en komen terecht in 1984.
Schoolvrienden C.J. en Sebastian zijn wetenschappelijke genieën en werken in hun vrije tijd aan hun nieuwste uitvinding: een rugtas waarmee je kunt tijdreizen. Maar als C.J.’s oudere broer Calvin na een aanvaring met de politie komt te overlijden, besluit het jonge duo hun onafgemaakte technologie op het spel te zetten in een poging om Calvin te redden.
Een minder stabiele elf, Bernard, ontdekt dat de enige manier om een aanval op de Noordpool te voorkomen tijdreizen is. Hij moet hiervoor het geheim van de kerstman zijn slee gebruiken: de 'Time Globe'. Hiermee kan hij terug in de tijd reizen en de kerstman redden. Maar misschien is het één keer redden van de kerstman wel te weinig.