El món sap que el multimilionari Tony Stark és Iron Man, el superheroi emmascarat. Sotmès a pressions per part del govern, la premsa i l'opinió pública perquè comparteixi la seva tecnologia amb l'exèrcit, Tony és poc inclinat a revelar els secrets de l'armadura d'Iron Man perquè tem que aquesta informació pugui caure en mans indesitjables.

Mèxic, 1821. Un emmascarat i romàntic heroi popular, conegut com El Guineu, lluita valentament contra el domini colonial espanyol a l'Alta Califòrnia. No obstant això, la vigília de l'alliberament de Mèxic, el despòtic governador don Rafael Montero descobreix que la Guineu és don Diego de la Vega. Un atac contra la casa del rebel, se salda amb la captura, la mort de la seva dona, el segrest de la seva única filla Elena i la destrucció de les seves propietats. Vint anys després, Montero torna de l'exili amb Elena, que ignora la identitat del seu pare, i es proposa comprar Califòrnia al president de Mèxic, el General Santa Anna.

Anglaterra, 984 dC. El jove príncep Einon és ferit greument en una revolta dels pagesos contra el seu cruel pare. Per salvar el fill de la mort, la reina el presenta a en Draco, un poderós drac que lliura una part del seu propi cor al noi i guareix la ferida amb un centelleig de foc. Un cop rei, l'Einon deixa anar els seus instints més malvats i governa com un tirà. El cavaller Bowen, instructor i protector de l'Einon, se sent llavors traït pel drac, a qui considera responsable de la maldat del rei, i jura dedicar la vida a matar tots els dracs del regne.

En Daniel i el senyor Miyagi viatgen a Okinawa, a la petita vila en la qual l'ancià va néixer i de la qual va haver de marxar per un assumpte d'honor. El seu pare està greument malalt i vol veure'l, però també li espera el seu antic amor de joventut. L'arribada del senyor Miyagi reobre unes ferides que el temps i la distància semblaven haver esborrat.

Dos anys després de derrotar els Decepticons, les vides de Sam i els Autobots han canviat molt. Mentre Sam es prepara per anar a la universitat, els seus amics robots s'han integrat en una força d'elit que captura enemics renegats. Però tot canvia amb l'arribada d'un enemic malvat que, amb un pla enrevessat, planeja un nou alçament dels Decepticons. La humanitat torna a estar en perill, i Sam i els Autobots hauran de formar una vegada més equip per salvar-la.