Una expedició científica a la recerca de fòssils al riu Amazones és interrompuda per una sorprenent i inesperada troballa: Gill-Man el llegendari monstre de la llacuna negra. Els exploradors capturen la criatura amb finalitats de recerca, però el monstre aconsegueix escapar-se. Entre la por i el caos desfermat pel desconegut parador en què es pot trobar Gill-Man, aquest torna per a segresta la preciosa Kay, promesa d'un dels investigadors de l'expedició, de la qual l'animal s'ha enamorat.

Dos membres de la tripulació d'una nau espacial, el Tinent Payton (Dennis Quaid) i el Cap Bower (Ben Foster), es desperten a les càmeres d'hibernació sense recordar res del que ha passat: ni qui són, ni quina era la seva missió o per què, aparentment, són els únics supervivents. Conformi s'endinsin a les zones més profundes de la nau, descobriran que no estan sols, i desvetllaran el terrible misteri que envolta la desaparició de la resta de la tripulació i dels passatgers. Aviat s'adonaran que mantenir-se amb vida és molt més important del que es puguin imaginar: és l'única manera d'evitar l'extinció de la raça humana.

En Billy i la Kate treballen a Nova York a l'empresa d'alta tecnologia del magnat Daniel Clamp. Ella fa de guia als visitants a qui ensenya les meravelles amb què treballa el seu cap i Billy té la feina condicionada per un executiu tafaner. A l'empresa Clamp també hi treballa el doctor Catheter a qui el laboratori se li converteix en una zona de joc dels Gremlins. La reaparició de Gizmo, el seu amic Mogwai, els recorda com tractar aquests animalets i tots tres col·laboren per impedir que provoquin una catàstrofe a les instal·lacions de l'empresa.

Margo Green, una biòloga jove i tenaç que treballa al Museu d'Història Natural, es veurà obligada a treballar al costat del tinent D'Acosta per mirar de resoldre la cadena de crims atroços i repugnants que es comencen a produir.