Batman torna per continuar la seva guerra contra el crim. Amb l'ajuda del tinent Jim Gordon i del fiscal del districte Harvey Dent, Batman es proposa destruir el crim organitzat de Gotham City. Sembla que tot va bé fins que apareix un nou criminal, el Joker, que desencadenarà el caos i el terror a la ciutat.
El FBI cerca a un assassí en sèrie, dit Buffalo Bill, que mata a les seves víctimes, totes elles adolescents, després de preparar-les minuciosament i arrencar-los la pell. Per poder atrapar-lo contacten amb Clarice Starling, una brillant llicenciada universitària, experta en conductes psicòpates, que aspira a formar part del FBI. Seguint les instruccions del seu cap, Jack Crawford, Clarice visita la presó d'alta seguretat on el govern manté tancat a Hanibal Lecter, antic psicoanalista i assassí, dotat d'una intel·ligència superior a la normal. La seva missió serà intentar treure-li informació sobre els patrons de conducta de "Buffalo Bill".
Scottie Fergusson és un detectiu de la policia de San Francisco que pateix de vertigen. Quan un company cau al buit des d'una cornisa mentre persegueixen un delinqüent, Scottie decideix retirar-se. Gavin Elster, un vell amic del col·legi, el contracta perquè vigili la seva dona Madeleine, una bella dona que està obsessionada amb el seu passat.
Dave Kujan (Chazz Palminteri), un agent especial que treballa per al servei de duanes dels EUA, està investigant les conseqüències d'un incendi a bord d'un vaixell al port de Sant Pere de Los Angeles, amb un balanç de 27 víctimes mortals. totes aparentment assassinades-. L'única font d'informació de Kujan és Roger Kint (Kevin Spacey), un estafador esguerrat que va sobreviure a l'incendi. A comissaria, Kint explica que tot va començar fa 6 setmanes a Nova York, quan 5 delinqüents, 5 "sospitosos habituals", van ser detinguts per a una roda de reconeixement referent al robatori d'un camió...
Neil McCauley és un lladre expert. La seva filosofia consisteix a viure sense lligams que puguin constituir un obstacle, si les coses es compliquen. La seva banda la formen criminals professionals tan qualificats que poden impressionar fins i tot el detectiu Vincent Hanna. Però Hannah viu tan obsessionat amb la feina que arriba fins i tot a posar en perill la seva relació sentimental. Quan la banda de McCauley prepara el cop definitiu i l'equip de Hannah intenta evitar-ho, cadascun d'ells comprèn que les ha de veure amb una de les ments més brillants a què s'ha enfrontat en la seva carrera.
El 1987, a Minnesota, Jerry, un venedor de cotxes, té greus dificultats econòmiques. Necessita tan desesperadament els diners que encarrega a dos sicaris que segrestin la seva dona. Jerry pretén cobrar el rescat a l'acabalat pare d'ella, i després pagar els raptors i saldar els deutes amb la resta de diners. Però el pla es complica quan els sicaris maten un policia i dos transeünts.
Betty, una jove aspirant a actriu, arriba a Los Angeles per convertir-se en estrella de cinema i s'allotja a l'apartament de la seva tia. Allà coneix la Rita, una dona que pateix amnèsia a causa d'un accident a Mulholland Drive. Les dues juntes decideixen investigar qui és la Rita i com va arribar-hi.
En Charlie Babbitt dirigeix una empresa de venda de cotxes esportius, que està en situació de fallida. Va a l'enterrament del seu pare i s'assabenta que només li ha deixat d'herència un cotxe, mentre que tota la fortuna ha anat a parar a en Raymond, el germà gran que en Charlie ignorava que existís. En Raymond és un autista dotat d'una extraordinària memòria, especialment per als números. En Charlie s'emporta en Raymond de la institució on viu amb la intenció de fer valer els seus drets. Durant un llarg periple, en Charlie passarà de la irritació a l'afecte per al seu germà, indefens davant del menor problema.
Durant la unificació italiana, la invasió de Sicília per part de les tropes de Garibaldi porta el Príncep de Salina i la seva família a refugiar-se a la casa de camp que tenen a Donnafugata. Tanmateix, el príncep és conscient que els temps estan canviant i, per tal de preservar la posició social de la família, empara el matrimoni del seu nebot amb la filla del nou alcalde del poble: un nou-ric de tendències liberals.
La pel·lícula consta de nou trames paral·leles que tenen lloc a la Vall de San Fernando, a Los Angeles: un nen prodigi, el presentador d'un concurs de televisió, un exnen prodigi, un moribund, el seu fill perdut, la dona i el infermer del moribund. Són històries aparentment independents, però que guarden entre si una relació estranya. Magnolia és el retrat de la vida americana vist a través d'una sèrie de vinyetes còmiques i commovedores.
Tom Reagan és el braç dret i millor amic de Leo O'Bannion, padrí de la màfia i amo de la ciutat. El dia que Johnny Caspar, petit caid irascible, sempre flanquejat del seu inquietant braç dret, el perillós danès, va queixar-se de les maquinacions de Bernie Bernbaum, Leo li prohibeix fer justícia ell mateix, sota pena de posar en marxa una guerra de clans.Leo protegeix en Bernie per amor a la seva promesa Verna, que és la germana de Bernie i que l'enganya amb Tom.
Atormentats per la mort de la seva dona, Michael i el seu fill Grant entaulen una gran amistat amb els seus nous veïns, els Hunts. Però, a mesura que les dues famílies estan més unides, Michael comença a sospitar que els seus veïns no són els que diuen ser, que alguna cosa han d'amagar, i fins i tot arribarà a pensar que ells tenen alguna cosa a veure amb la mort de la seva dona...
Hannon Fuller, un magnat dels negocis i empresari emprenedor, mor en estranyes circumstàncies. El seu amic i ma dreta a la feina, Douglas Hall, es veu arrossegat a una voràgine de crim i decepció quan la mort del seu superior li comença a revelar una perillosa doble vida que es mou entre dos mons paral·lels, un el 1937 i un altre en el present...
Un antic cantant de rock ha estat brutalment assassinat. L'última vegada que se'l va veure estava acompanyat per la seva novia. A la comissaria, al departament d'Afers Interns, Nick Curran rep l'encàrrec de vigilar Catherine Tromell, la suposada núvia assassina.
Glasgow, principis dels anys 50. Joe és un jove que troba feina en una barcassa propietat de Les i la seva enigmàtica dona Ella. Una tarda, Joe i Els troben el cos d'una dona flotant a l'aigua. Tot i que la policia arresta un sospitós, es fa cada cop més evident que Joe sap més de la dona ofegada del que diu. Amb la investigació de l'assassinat com a teló de fons, Joe i Ella s'embarquen en una aventura íntima i passional.