オゾン層が破壊され危険な太陽光が降り注ぎ、原子力事故により地表が放射性物質で汚染され、人類が地下に住むようになった世紀末後の未来の都市が舞台。 あるカルト教団の施設「聖NOVA'S CHURCH」を襲撃、制圧した武装警官隊。その中の警官2人は、教団施設の奥で翼の生えた少女を発見する。2人は彼女を救助するも、研究資料として今度は政府機関の施設に連れ去られてしまった。2人は彼女を空へ帰そうと奮闘する。都市の出口には「注意阳光！」「不保障生命」という警告が示されていたが、それでも自らの犠牲を厭わず突き進んで行った。

謎の力によって地球の軌道から外れた月が、我々人類が知る限りの生命体と衝突するコースへと急降下する。衝突まであと数週間、世界は滅亡の危機に瀕していた。NASAの重役で元宇宙飛行士のジョー・ファウラーは、人類を救う鍵を持っていると確信していたが、彼女の過去を知る唯一の人物で宇宙飛行士のブライアン・ハーパーと陰謀論者のK・C・ハウスマンだけしか彼女を信じていなかった…。

ミッション遂行のため、火星へと向かう3人の宇宙飛行士。だが、予定外の人物が宇宙船に乗り込んでいたことで、全員の命が危険にさらされ、難しい決断を迫られる。

宇宙飛行士スペンサーとアレックスは、シャトルの船外作業中の事故から奇跡的に生還する。だが地球に戻った矢先、アレックスが変死、妻ナタリーも自殺する事件が起こった。スペンサーの妻ジリアンは、元NASA局員と名乗る調査員シャーマンと接触、宇宙で連絡の途絶えた空白の2分に不審な点があること、そしてナタリーが双子を妊娠していたことを知り戦慄する。彼女もまた、夫の帰還後に双子を身ごもっていたのだ。