Bruce Wayne og Jim Gordon kommer til Gotham City. Efter at have set omfanget af korruption i byen går de i gang med at bekæmpe den på hver sin måde. Gothams skurke terroriseres af den mystiske Batman, og den heltemodige Gordon udses til at fange ham af dem, som både hader og frygter ham. Under jagten opstår et uventet venskab, og legenden begynder at tage form.

I et alternativt univers kæmper meget forskellige versioner af DC's Trinity mod regeringen, efter at de er beskyldt for en ambassade bombning.

Albert Gæmelkrå (Loppen) spenderer sine dage i en celle på Dragsbrogs sindssygeklinik. Pelle, der nu er fyldt tretten, nyder livet som superhelt. Hans største ønske er at blive kæreste med veninden Ida, men det er ikke så let. Samtidig står myredrengen pludseligt overfor en mere skrupelløs rival, nemlig Christian – den nye dreng i skolen, der ikke skyer nogle midler for at stjæle Ida fra ham. Og som om det ikke er nok, så er Pelle også hjemsøgt. Antboy og Wilhelm tror først, at det er et poltergeist, der er på spil. Men det viser sig hurtigt, at det er en ny superskurk, der har meldt sig på banen.