De slotfilm van de Gintama-animeserie, waarin de laatste hoofdstukken van de gelijknamige mangaserie, geschreven door Hideaki Sorachi, zijn aangepast. De film beslaat de hoofdstukken 699-704 van de originele manga, waaraan origineel materiaal is toegevoegd.
De scholier Hodaka Morishima verlaat zijn huis op een afgelegen eiland en verhuist naar Tokio. Hij heeft geen geld en geen sociale contacten. Hodaka vindt uiteindelijk een baan als schrijver voor een occult tijdschrift. In een hoek van de drukke stad ontmoet hij een jong meisje, genaamd Hina Amano. Zij blijkt geheime bovennatuurlijke krachten te hebben.
De brutaalste boekaniers ter wereld zetten koers naar het grote Piratenfestival, waar de Straw Hats meedoen aan een doldwaze race om de schat van Gol D. Roger te vinden. Er is alleen één klein probleempje: een oud lid van Rogers team heeft een sinistere rekening te vereffenen.
In de niet zo verre toekomst en beïnvloed door de ’Robot Ethics Committee’ wordt het gebruik van androids gemeengoed. Deze worden door de mensen gezien als gebruiksvoorwerpen. Slechts enkelen kunnen begrip opbrengen voor hen vanwege hun menselijke voorkomen. Bekend onder de naam ’android-holics’, zijn zij een sociaal probleem geworden en dat wordt alleen maar erger wanneer sommige androids echte mensen willen worden.
Deze aflevering draait om de 'Lost Room', een plek waar je kunt vinden wat verloren is gegaan, of degenen die verdwaald zijn. Deze kamer, die van niemand is, ligt vergeten in een hoekje van Chaldea.
Uta is de meest geliefde zangeres ter wereld en staat erom bekend dat ze haar identiteit verbergt tijdens haar optredens. Nu, voor de allereerste keer, zal Uta zichzelf aan de wereld tonen tijdens een concert op het muziekeiland Elegia. Dit trekt de aandacht van piraten, de marine en Monkey D. Luffy en zijn bemanning. Ze komen allemaal naar het concert om van Uta's stem te genieten, die omschreven wordt als buitenaards. Het evenement begint echter met een schokkende onthulling: Uta is de vervreemde dochter van Red-Haired Shanks - Luffy's grote idool.
De oceanograaf Steve Zissou heeft z'n beste tijd wel gehad. Wanneer zijn partner tijdens het filmen gedood wordt door een jaguarhaai, stelt Zissou een crew samen om wraak te nemen op het mysterieuze beest. Onder de crew bevinden zich onder anderen zijn van hem vervreemde vrouw, een journaliste die een stuk over hem wil schrijven en een man van wie hij wel eens de biologische vader zou kunnen zijn.
Het pad van een samoerai leidt hem naar een jonge serveerster wiens geboortestad werd verwoest door een draak. Hij wil geen problemen, maar hij vindt ze toch.
De jonge weduwe Laura, moeder van drie kinderen, besluit te hertrouwen met Bob. Het gezinnetje verlaat het ruime huis van Laura voor een woning heel ver weg, in een andere staat. Peter, Jamie en Hope zijn niet gelukkig met deze verhuizing, vooral omdat hun trouwe huisdieren, de honden Shadow en Chance en de kat Sassy, niet mee kunnen. De dieren worden aan de zorgen van Kate toevertrouwd, die woont op een boerderij in de bergen. Al snel missen de drie dieren hun vriendjes en ondernemen zij pogingen om hen terug te vinden.
De jonge Jim Hawkins komt in het bezit van een kaart die de verborgen schat van de beruchte piraat kapitein Flint aanduidt. Samen met zijn vrienden, de landjonker Trelawney en Dr. Livesey, vaart hij naar Schatteneiland om er de schat te gaan zoeken.
De harde, maar coole detective John Shaft arresteert de racistische Walter Wade Jr. na een uit de hand gelopen ruzie. Maar Wade weet met gemak weer vrij te komen door de invloed en het geld van zijn rijke vader en door het feit dat de enige ooggetuige spoorloos verdwenen is. Als Wade twee jaar later opnieuw wordt opgepakt, zet Shaft alles op alles om die ene ooggetuige te vinden en Wade voorgoed achter de tralies te zetten.
Op het gigantische, luxe cruiseschip Poseidon dat over de Noord Atlantische Oceaan vaart, is een schitterend feest begonnen om het nieuwe jaar in te luiden. Maar terwijl in de balzaal de champagneglazen worden geheven, is er op de officiersbrug groot alarm. Een reusachtige vloedgolf van wel dertig meter hoog stormt razendsnel op het schip af en kan niet meer ontweken worden. Met een kolossale kracht laat de golf het grote schip kapseizen, voordat het helemaal ondersteboven komt te liggen.