Em tempos de paz os samurais não eram necessários e estavam a viver em completa miséria sem uma casa para servir. Alguns pediam para realizar o haraquíri "hara-kiri" (seppuku) dentro das residências dos nobres apenas para lhes extorquir dinheiro, mas com pena dos guerreiros os senhores davam-lhes algum dinheiro e mandavam-nos embora. Um nobre recebe um jovem samurai com esse mesmo propósito e decide obrigá-lo a tirar a sua própria vida.

A história ocorre em 1860 e baseia-se na chegada de um ronin a uma cidade que sofre com a guerra entre duas gangues. Kuwabatake Sanjuro, que significa "Amoreira de 30 Anos" (Toshirō Mifune), aproveitando a sua perspicácia tenta ganhar dinheiro e, ao mesmo tempo, livrar a cidade das gangues rivais, ora associando-se a um grupo, ora associando-se a outro, tirando proveito da situação e manipulando-os, devido ao despreparo estratégico dos dois grupos, que é demonstrado através de diversas cenas satíricas durante o filme.

O que aconteceria se Shiroyasha nunca tivesse existido? Edo é lançada ao caos por uma causa misteriosa. Sakata Gintoki agora vive em um mundo onde o futuro foi alterado, sem ele. O que aconteceu com o Yorozuya? Gintoki, que agora é um fantasma do passado, deve voltar a carregar o fardo a fim de salvar seus amigos. Ele deve terminar o trabalho mais importante da sua vida, o que pode ser o trabalho final do Yorozuya.

No Japão do século 16, os camponeses Genjuro e Tobei vendem as suas panelas de barro para um grupo de soldados numa vila próxima, desafiando a advertência de um sábio local contra a tentativa de lucrar com a guerra. A busca de Genjuro por riquezas e a misteriosa Lady Wakasa, assim como o desejo de Tobei de se tornar um samurai, correm o risco de destruir tanto a si quanto as suas esposas, Miyagi e Ohama.

No Japão, por volta do século XVIII, nove jovens decidem apresentar uma acusação de corrupção do seu clã ao superintendente local. No entanto, o grupo é traído, mas o ronin Sanjûrô Tsubaki (Toshirô Mifune), um samurai desalinhado e cínico, salva os homens do superintendente. Então o tio do líder do clã rebelde, o Chamberlain Mutsuta (Yûnosuke Itô) é sequestrado e a sua esposa e filha são detidas e feitas prisioneiras pelo superintendente que tenta forçar Mutsuta a escrever uma falsa carta de confissão declarando ser corrupto. Sanjûrô ajuda o grupo a resgatar o Chamberlain e sua família.

Um garoto chamado Kotarou está sendo perseguido por uma guarda chinesa misteriosa, e foge acompanhado de seu cão Tobimaru. Kotarou segue sozinho em seu caminho até se encontrar com o espadachim Nanashi num mosteiro abandonado. Um tanto para se redimir de um passado terrível, Nanashi acaba por acompanhar Kotarou na sua viagem, protegendo-o.

Misawa é um samurai que não consegue encontrar emprego, mas que é um gênio da arte de lutar. Ao lado de sua mulher, ele é obrigado a parar em uma pequena hospedaria por causa de uma enchente. Vendo as péssimas condições do local, ele parte em busca de alimento para o povo, logo despertando a desconfiança de sua mulher, que não gosta que ele lute por dinheiro. Mesmo sem a conduta real de um samurai, é contratado para treinar a tropas do feudo local, despertando a inveja dos outros lutadores. Filmado após a morte de Akira Kurosawa, pelo seu fiel assistente de direção Takashi Koizumi. Um dos últimos roteiros do mestre oriental.

Ikoma e a Fortaleza de Ferro levam o combate para os campos de batalha de Unato, unindo esforços para reclamar a região aos Kabanes.

Quando o corpo do seu pai foi roubado do túmulo, Afro (Samuel L. Jackson) retoma a sua espada novamente para destruir um exército de inimigos mortais liderados por um sádico líder. E também tendo que enfrentar a fúria de Sio (Luci Lyu), uma habilidosa guerreira que busca ressuscitar seu irmão Kuma para exterminar Afro. O personagem foi criado pelo artista de mangá Takashi Okazaki e a produção executiva da animação é do ator Samuel L. Jackson, que também faz a voz do personagem principal. A atriz Lucy Liu atuará dessa vez como a vilã, chamada Sio, descrita como "uma sádica e sedutora mente do mal que trama destruir o Afro Samurai". Ainda fazem parte do elenco de vozes nomes como Mark Hamill e Yuri Lowenthal. A história mostra um samurai negro que luta para vingar a morte de seu pai, em um mundo onde a tecnologia e o duelo de espadas coexistem.