1963年、ワイオミング州ブロークバック・マウンテン。定職のないイニスとジャックは、羊放牧の職を得て、共にひと夏を過ごすことになる。大自然の中でお互いを助け合ううちに、彼らに深い絆が生まれる。それがごく自然に男同士の関係へと変化していくのに、それほど時間はかからなかった。しかし、保守的な時代、閉鎖的な土地…厳しい社会の現実が２人の関係に影を落とし始める。

1980年、マドリード。新進気鋭の映画監督エンリケ（フェレ・マルチネス）の元に、神学校の寄宿舎で共に少年時代を過ごしたイグナシオ（ガエル・ガルシア・ベルナル）が訪ねてくる。幼い頃の面影が全くないイグナシオにエンリケはとまどうが……。