La humanitat és amenaçada pels Drej. L'assalt a la Terra és imminent i l'èxode comença per a milions d'éssers humans.

Harrington High és una escola de parets brutes, antiquats llibres de text i professors cremats. No hi ha diners per a excursions ni per a ordinadors nous ni per al departament de Música. Els alumnes són molt heterogenis: solitaris, líders, colles i cervellets. Com tots els adolescents del món, les han de veure amb uns pares que no els entenen, amb uns professors que els subestimen i, a més, amb les seves actives hormones. El que ignoren és que estan a punt d'enfrontar-se amb una cosa que mai no podrien haver imaginat.

En una societat futura, algunes persones són triades en néixer per convertir-se en soldats, i entrenats amb tanta precisió que es transformen en màquines de matar éssers humans. Un d'aquests soldats més destacats mesura les seves forces amb una nova casta de soldats, i després de la confrontació se'l considera mort. El seu cos és abandonat en un planeta colonial semidespoblat, on coneixerà altres aspectes de la vida. Però haurà de lluitar novament contra aquesta casta de soldats... aquesta vegada per defensar la seva nova llar.

Després d'aconseguir escapar amb Newt i Bishop d'un planeta alienígena, la tinent Ellen Ripley (Sigourney Weaver) recala accidentalment a Fiorna 161, una remota presó galàctica els perillosos reclusos de la qual estan absolutament abandonats a la seva sort.

En el seu improvisat laboratori, uns nois utilitzen un descobriment inesperat i el seu enginy per construir la seva pròpia nau espacial i llançar-se en un fantàstic viatge interplanetari.

Més de dos-cents anys després de la seva mort, Ripley (Sigourney Weaver) torna a la vida gràcies a l'ús de tècniques avançades de clonatge. Però, durant el procés, l'ADN de Ripley s'ha barrejat amb el de la Reina Alien, per la qual cosa Ripley comença a desenvolupar certes característiques de la perillosa alienígena.