Na teruggekeerd te zijn van hun huwelijksreis horen Shrek en Fiona dat haar ouders van het huwelijk gehoord hebben. Ze willen niets liever dan haar ware liefde te ontmoeten in hun koninkrijk Far Far Away. Ze zijn zich echter niet bewust van de veranderingen die hun dochter onlangs ondergaan heeft. En dat hun nieuwe schoonzoon een 350 kilo zware Ogre met een slechte hygiëne is en een pratende ezel als vriend heeft.
Peter Pan is inmiddels volwassen en gaat door het leven als Peter Banning. Hij is advocaat met een drukbezette agenda en een klein beetje overgewicht. Peter is al lang vergeten dat hij ooit Peter Pan was, de jongen die kon vliegen en nooit zou opgroeien. Wanneer hij voor een galadiner naar Londen moet, worden zijn kinderen gekidnapt door de beruchte Captain Hook. Om zijn kinderen te redden moet Peter Pan, met behulp van de Lost Boys (die hem weer leren hoe hij moet leven en vliegen), terugkeren naar Neverland. Peter Pan wordt bijgestaan door Tinkerbell, die kleine fee die haar hart aan Peter Pan heeft verpand. Bob Hoskins is Smee, Hook's rechterhand in piraterij en plunderij.
Mo Folchart heeft een wonderlijk maar soms verschrikkelijk talent. Als hij hardop voorleest uit boeken, brengt hij de personages tot leven. Wanneer hij op een dag voorleest uit het boek Inkheart, haalt hij een aantal gemene personages uit het boek en in de echte wereld. Alsof dat nog niet erg genoeg is, verdwijnt zijn vrouw in het boek. Zijn dochter Meggie weet niets van haar vaders talent, alleen dat hij tot op de dag van vandaag weigert voor te lezen.
De gemene stiefmoeder van Broertje en Zusje vergiftigt hun vader. Broertje en Zusje houden het daarna niet meer uit bij hun stiefmoeder en stiefzus en vluchten. Door een vloek verandert Broertje in een ree. De twee bouwen een leven op in het bos en alles gaat goed, totdat de koning besluit te gaan jagen.
Mace en Cindel Towani zijn verdwaald op de maan van Endor. Hun ouders zijn gekidnapt door Gorax, een reuze-monster, en Wicket en de andere Ewoks zijn de enige die Mace en Cindel kunnen helpen om ze te redden. Eerst vertrouwt Mace de Ewoks niet, maar gelukkig kan zijn vier jaar oude zusje Cindel hem van gedachten doen veranderen.
Een prinses laat haar gouden bal in een bron vallen. Een lieve kikker wil hem er graag uithalen, in ruil voor vriendschap. De prinses vergeet echter haar belofte. Wanneer de kikker terugkomt, blijkt het geen lelijke kikker te zijn, maar een knappe prins...