Een kroniek die een zeldzaam inzicht biedt in de internationale perceptie van de oorlog in Irak, met dank aan Al Jazeera, het populairste nieuwskanaal in de Arabische wereld. De zender werd ronduit bekritiseerd door kabinetsleden en functionarissen van het Pentagon vanwege hun pro-Iraakse vooringenomen berichtgeving, en werd sterk veroordeeld vanwege het veelvuldig uitzenden van civiele causaliteiten en beelden van Amerikaanse krijgsgevangenen. Ze hebben alles onthuld (en blijft de wereld laten zien) over de oorlog in Irak. dat de regering-Bush niet wilde dat zij het zagen.

Fahrenheit 9/11 handelt over de vermeende relatie tussen de families van George Bush enerzijds, en de families van Osama bin Laden anderzijds. De film start kort na de controversiële verkiezingsuitslag van november 2000.

Amerikaanse soldaten van de 2/3 Field Artillery, een groep die bekend staat als de 'Gunners', vertellen over hun ervaringen in Bagdad tijdens de oorlog in Irak. Verscholen in een gebombardeerd plezierpaleis gebouwd door Sadaam Hussein, doorstonden de soldaten vijandige situaties zo'n vier maanden nadat president George W. Bush het einde van de grote gevechtsoperaties in het land had afgekondigd.

Ouders proberen te begrijpen waarom hun kinderen vanuit Groot-Brittannië zijn gereisd om zich bij het Koerdische leger aan te sluiten in hun strijd tegen Isis, in Syrië, waar ze zijn omgekomen in de strijd tegen de oorlog van iemand anders.

Morgan Spurlock zet zijn zinnen op de beruchte terroristenleider Bin Laden en vraagt zich af waarom hij nog steeds niet gevonden is, zodat hij berecht kan worden. Per kameel reist hij het Midden-Oosten af op zoek naar Bin Laden en zet zich in om de uitgeloofde premie van 25 miljoen dollar door de Amerikaanse overheid op te strijken.