Kirikou pochodzi z malutkiej wioski w Afryce. Jest niezwykłym chłopcem - umiał mówić kiedy jeszcze był w brzuchu swojej matki, po przyjściu na świat od razu potrafił chodzić. Rodzinną wioskę bohatera gnębią źli czarownicy Karaba. Rzucili na okolicę klątwę, która sprowadziła długą i straszną suszę. Kirikou postanawia zdjąć przekleństwo. Czy jednak mały chłopiec zdoła rzucić wyzwanie potężnym czarodziejom.
Na początku lat pięćdziesiątych, nad brzegiem rzeki Marny, François, 11-letni chłopiec, jest zaintrygowany odkryciem, że jego rodzice budują łódź w swoim małym ogrodzie. To replika słynnej żaglówki Joshuy Slocuma. Z biegiem lat, w powojennej Francji, François przechodzi od okresu dojrzewania do dorosłości. Budowa łodzi trwa, a młody chłopak wyrusza po własną przygodę, która poprowadzi go do odkrycia własnej pasji do morza i do rysowania.