Al cap de 40 anys, la tinent Ripley, única supervivent de la nau "Nostromo", es recollida de la seva càpsula de salvament i deshivernada. Durant tot aquest temps el planeta d'on va sortir l'Alien, el LV-426, és colonitzat però s'ha perdut tota comunicació amb els seus habitants. Per investigar el succeït s'envia un equip de marines espacials, amb Ripley al capdavant de l'expedició. El que els espera allà no és només una criatura, en són milers....
L'estat emocional del Dr. Powell està sent desafiat per un dels seus pacients al pavelló de psiquiatria; Prot, qui reclama ser d'un altre planeta, ha anunciat la seva partida de la terra, i la resta dels pacients s'apunten també per anar amb ell. Aquesta situació deixa al Dr. Powell preguntant-se sobre les seves pròpies habilitats per distingir la realitat de la fantasia.
El gendarme Beaupied afirma que ha vist un plat volador i tots el prenen per boig fins que el brigada Cruchot, també veu un OVNI. Els extraterrestres es metamorfosegen en gendarmes, cosa que provoca l'enfrontament entre aquests i els gendarmes reals.
Allan Quatermain, un famós caçador, emprèn un safari pel cor d'Àfrica. Alhora, Elizabeth Curtis, acompanyada del seu germà John, s'interna a la zona més inhòspita del continent per buscar el seu marit, desaparegut mentre buscava les mines del Rei.
Jack Giamoro (Ben Affleck), el millor caçatalents de Los Angeles, sembla tenir-ho tot: una carrera d'èxit, diners i una dona (Rebecca Romijn). Però se sent buit i decideix assistir a les classes de creació literària del pompós i temperamental senyor Primkin (John Cleese). Comença llavors a escriure un diari per analitzar els seus sentiments i replantejar-se la vida. Quan descobreix que la seva dona ho està traint amb el seu client més important, el guionista de telesèries Phil Balow (Adam Goldberg), la seva vida comença a trontollar. Però les coses es torcen encara més quan una ambiciosa periodista (Bai Ling) roba a Jack el seu diari, que conté secrets que podrien acabar amb la seva vida personal i professional. Jack intentarà recuperar-ho i, en fer-ho, acaba aprenent molt sobre si mateix.
A Califòrnia, un ancià lamenta la pèrdua de la seva dona i l'endemà també mor. No obstant, el soldat espacial Eros i la seva companya Tanna usen un dispositiu elèctric per ressuscitar-los a tots dos i al fort inspector Clay que va ser assassinat per la parella. La seva intenció no és conquerir la Terra sinó evitar que la humanitat desenvolupi la poderosa bomba “Solobonita” que amenaçaria l'univers. Quan la població de Hollywood i Washington DC veu platets voladors al cel, un coronel, un tinent de policia, un pilot comercial, la seva dona i un policia intenten aturar els extraterrestres.