De opwindende pilot-aflevering van lange duur, 'Rising', stuurt een briljant team van wetenschappers door een Stargate naar de legendarische stad Atlantis. Maar niet alleen staat de stad op het punt te worden overspoeld door oceaanwater, er verschijnt ook een vijand die iedereen in het Pegasusstelsel bedreigt! En in het verlengde 'Enemy at the Gate' uit seizoen 5, terwijl het team de Wraith-bijenkorfschepen probeert uit te schakelen, ontdekken de Wraith coördinaten waarmee ze de aarde kunnen vernietigen!
De 18-jarige Helen Memel ligt op de proctologische afdeling van een ziekenhuis. Ze wacht op een operatie wegens een anale fissuur, opgelopen in een poging om haar anusstreek te ontharen. Helen koestert nog steeds de hoop dat haar gescheiden ouders door haar hospitalisatie opnieuw samen komen. Ze probeert dit te forceren door haar verblijf in het ziekenhuis te verlengen en te spreken over haar vroegere seksuele experimenten.