Lucas is nog jong en woont bij zijn tante in een rustig, landelijk gelegen stadje. Zijn tante is uiterst religieus. Lucas helpt zijn tante bij het organiseren van christelijke bijeenkomsten voor vrouwen uit de buurt. Het rustige leventje van Lucas verandert, zodra zijn tante de komst aankondigt van een andere neef. Het gaat om Mario, die net vrijgelaten is uit de gevangenis.

Homer Smith, een op het moment werkloze bouwvakker, trekt richting het westen als onderweg zijn auto ermee op houdt. Midden in de woestijn gaat hij op zoek naar water als hij met geluk een boerderij tegen komt. Hier werken katholieke nonnen, onder de leiding van zuster Maria.

Twee nonnen komen naar Rome om bij een luchtvaartmaatschappij te protesteren tegen de straalvliegtuigen die over hun kloosterschool vliegen, waardoor het onderwijs aan de kleine weeskinderen die daar studeren wordt verstoord en door geluidstrillingen het oude fresco van hun patroonheilige wordt beschadigd.

Een pelgrimstocht van twee zwervers voert hen langs alle excessen en vormen van ketterij die sinds het ontstaan van het christendom hebben bestaan. Dit resulteert in een surrealistische reeks episoden, visioenen, ontmoetingen en dromen waarin religie uitsluitend doelwit is voor harde satire.

Predikant O'Malley wordt naar de St. Marien-school gestuurd, die er zowel financieel als bouwkundig slecht voor staat. Zuster Benedikt doet haar uiterste best er nog wat van te maken en ze is blij met O'Malley's hulp.

De vriend van Yolanda, een zangeres en drugsverslaafde, overlijdt aan een overdosis. De politie zoekt haar en zij besluit om zich te verstoppen in een nonnenklooster. Het kloosterleven bestaat echter niet alleen uit gebed en liefde tot de Heer.

Jack Black is hilarischer dan ooit in zijn rol als Ignacio, een kloosterkok die overdag voor weeskinderen zorgt en s'nachts verandert in Nacho Libre, een beruchte worstelaar in strakke outfit. Aangespoord door straatjongeren en partner Esqueleto 'het skelet', stapt Nacho in de ring met Mexico's meest gevreesde worstelaars om zijn weeskinderen te redden en de aandacht te trekkken van zuster Encarnacion- zijn inspiratiebron en geheime liefde.

Brian en Charlie zijn twee bankovervallers die hun leven willen beteren. Ze willen nog één zware slag slaan en dan de benen nemen naar Brazilië om daar met een nieuw leven te beginnen. Maar hun plannetje dreigt te mislukken wanneer ze achternagezeten worden door een rivaliserende bende, The Triads. Ook hun baas, de meedogenloze Case, is niet van plan om Brian en Charlie zomaar te laten vertrekken. Ten einde raad duiken Brian en Charlie met hun buit voorlopig onder in een nonnenklooster.

De Belgische non zuster Ann wordt naar een andere orde gestuurd waar ze zich in eerste instantie inzet voor het helpen van zielen in moeilijkheden, zoals Nichole en de kleine Dominic. Als pater Clementi de opzwepende zangstijl van zuster Ann hoort, neemt hij haar mee naar een talentenjacht. Zuster Ann heeft een platencontract getekend en iedereen luistert naar haar luchtige liedjes. Ze is niet voorbereid op haar nieuwe bekendheid (zoals haar optreden in The Ed Sullivan Show) en ongewenste bijwerkingen, waaronder een onrechtmatige aantrekkingskracht op een oude vriend.

Jaren geleden werd er in het plaatselijke klooster een meisje vermoord en mishandeld. Het klooster is ondertussen gesloten, maar wordt nog regelmatig gebruikt door tieners die er wilde feestjes houden. Op een avond roepen de tieners per ongeluk de geest op van een oude non, die meteen alle registers opentrekt en een horde zombie-nonnen op de jongeren afstuurd.

Een komedie over het jonge stel Susan en Mike die na 18 maanden in het geheim te hebben samengewoond besluiten te trouwen, alhoewel Mike nog zo zijn twijfels heeft. Hoewel beide families verrukt zijn over het nieuws, nemen de spanning en opwinding in aanloop naar de bruiloft toe. Er komen nogal wat sex gerelateerde geheimen van de familie boven water wat leidt tot een aantal familieruzies die tot nu toe onderdrukt waren.

Een oude westerse stad wordt volledig bevolkt door schattige jonge katholieke schoolmeisjes en nonnen met jachtgeweren die de hele mannelijke bevolking hebben vermoord. De nonnen leren hun vrouwelijke studenten dat alle mannen slecht zijn. De meisjes worden verdedigd door een superheld genaamd 'Panty Mask', die verschijnt met een leren bikini en een leren meisjesondergoed op haar gezicht. De nonnen aanbidden een ijssculptuur van Christus die de mogelijkheid heeft om hun frisdranken koud te maken (die ze niet delen met de studenten).

Derde in de Nunsense-musicalreeks.