In de toekomst zijn regeringen en economieën over de hele wereld ingestort. Voedsel is schaars, NASA bestaat niet meer en de 20ste eeuw is de grote schuldige. Wanneer een mysterieus wormgat in de ruimtetijd opengaat is het aan een groep overblijvende onderzoekers van NASA om op verkenning te gaan en de mensheid hoop te bieden.
Een acht uur durende fictiefilm, opgenomen gedurende in totaal zevenentwintig weken, over een periode van veertien maanden, in een dorpsbevolking van zevenenveertig mensen in de bergen van de prefectuur Kyoto, Japan. Het is een geografische beschrijving van het werk en niet-werk van een boer. Een portret, over vijf seizoenen, van een familie, van een terrein, van een soundscape en van de duur zelf. Een film-als-adaptief-landschap.
'Dark Waters' vertelt het waargebeurde verhaal over de blootlegging van een gruwelijk mileugeheim. Een advocaat, Robert Bilott genaamd, ontdekt een verband tussen een aantal mysterieuze sterfgevallen en chemiebedrijf DuPont, één van de grootste bedrijven ter wereld. Om de waarheid te achterhalen zet hij zowel zijn toekomst als zijn familie en zijn leven op het spel.
Oscar Ramirez en zijn familie ontvluchten hun arme leven in de rijstvelden van de noordelijke Filipijnen om op zoek te gaan naar een betere toekomst in de enorme stad Manilla.
Helmer, een alleenstaande boer van midden vijftig, brengt zijn bedlegerige vader naar de zolder om niet langer naar zijn wil te hoeven leven. Als de 18-jarige Henk zijn knecht wordt, komt er eindelijk beweging in zijn leven. Helmer komt door de ziekte van zijn vader tot het besef dat hij nooit het leven heeft geleid zoals hij dat zelf zou willen.
Het verhaal speelt zich af in de jaren tachtig in het landelijke Middenwesten van de Verenigde Staten. De moedige 11-jarige Gitty ontdekt op een dag dat haar geliefde vader een rijke man in een silo van haar familie verbergt om zijn boerderij waar de zaken niet goed gaan te redden. Ze wordt nu gedwongen te kiezen tussen het redden het leven van de man of haar familie te beschermen tegen de gevolgen van hun daden.