Terpuruk setelah ada pengakuan mengejutkan dari sang istri, seorang dokter kelas atas New York City memulai petualangan sepanjang malam di dunia bawah tanah yang erotis.

Terluka dan menderita amnesia, Jason Bourne mulai merekonstruksi kembali hidupnya. Namun, ia mendapati banyak orang yang ditemuinya justru menginginkan kematiannya.

Sekali lagi Bourne dibawa keluar dari persembunyiannya secara tidak sengaja oleh wartawan bernama Simon Ross untuk mengungkap Operasi Blackbriar, kelanjutan dari proyek Treadstone dalam serangkaian kolom surat kabar. Informasi dari wartawan mengungkapkan sebuah ingatan, dan Bourne akhirnya mengungkap masa lalu yang gelap sementara menghindari upaya terbaik Perusahaan untuk menyingkirkannya.

Liburan sebuah keluarga ke rumah sewaan mewah berubah menjadi mencekam ketika serangan siber melumpuhkan perangkat mereka dan dua orang asing muncul di depan pintu.