Een compilatiefilm waarin de hele serie Persona 4 The Animation wordt samengevat met nieuw beeldmateriaal.
Het avontuur begint met het verschijnen van Mewtwo, een genetisch gemanipuleerde Pokémon, gecreëerd uit het DNA van Mew, de zeldzaamste van alle Pokémon. Mewtwo is vastbesloten om zijn superioriteit te bewijzen en verleidt Ash, Pikachu en de anderen in een strijd, zoals er nog nooit is geweest: Mewtwo tegen Mew, superkloon tegen Pokémon. Het gaat hier om de ultieme confrontatie met de toekomst van de wereld als inzet.
Wanneer Ryu terugkeert om hulde te brengen aan zijn overleden mentor, Gouken, wordt hij gekweld door verontrustende herinneringen aan de moordenaar van zijn meester (Gouki). In een zoektocht om een echte vechtsportmeester te worden, wil hij zijn straatvechtvaardigheden aanscherpen en zichzelf bevrijden van de angstaanjagende erfenis van de duistere hadou.
Dit is het verhaal van een jong, zelfstandig meisje genaamd Ai, dat op een dag naar het Dierendorp verhuist. Terwijl ze in Tom Nooks winkel 'Nook's Cranny' werkt, begint ze haar leven weg van haar familie te leiden. Om te beginnen kent ze links niet van rechts, maar onder leiding van burgemeester Tortimer, de boze maar correcte meneer Resetti, en de rondzwervende muzikant K.K. Onder meer Slider wordt ze uiteindelijk geaccepteerd als lid van het dorp. Op een avond, terwijl ze langs het strand loopt, vindt ze een bericht in de fles. Het zet haar op een zoektocht om pijnbomen rond het dorp te planten om een wonder te vervullen aan de vooravond van het Winterfestival.
Het 'Umbrella-incident', dat plaatsvond in Raccoon City, werd door de overheid beëindigd met een krachtige raketaanval met de intentie het zombie-virus volledig uit te roeien. Nu, zeven jaar later, wordt er op een vliegveld ergens in de Verenigde Staten echter opnieuw een zombie uitgezet. Het vliegveld begint zich langzaam maar zeker te vullen met de ondoden, en het macabere incident van zeven jaar eerder lijkt zichzelf te herhalen. Claire Redfield is toevallig aanwezig op dit vliegveld.
Een enorme kristallen catastrofe wordt losgelaten op Greenfield — en Ash, Pikachu en hun vrienden moeten uitzoeken hoe ze de schade aan de eens zo prachtige stad ongedaan kunnen maken. Dan gebeurt er iets vreselijks: de moeder van Ash wordt ontvoerd door de machtige Entei, een Pokémon waarvan werd gedacht dat hij alleen in legenden bestond.
Ryu (Kosugi) wordt door een jongen bezocht die claimt zijn broertje te zijn. Hij komt erachter dat deze jongen bezeten is door de dark Hado. Zelf vecht Ryu ook tegen zijn duistere kant die steeds naar boven komt, maar hij wil niet zo eindigen als de slechte Akuma. Ondertussen moet hij het ook nog opnemen tegen een gestoorde wetenschapper die het voorzien heeft op de ongelooflijke kracht die Ryu in zich heeft.
Twee jaar na de gebeurtenissen in de game Final Fantasy VII, wordt ex-militair Cloud Strife geconfronteerd met een nieuw gevaar, genaamd het Star-Scar Syndrome. Ook Sephiroth lijkt opnieuw zijn opwachting te maken.
Na de val van Shadaloo werd het stil en ging iedereen door met zijn dagelijkse routine. Er loert echter een nieuw kwaad aan de horizon en de strijders die tegen Shadaloo hebben gestreden, moeten opnieuw de wapens opnemen. Ondertussen gaat een mysterieuze detective, wiens motieven onbekend zijn, tot op zekere hoogte op zoek naar de eenzame zwerver Ryu, die een grote rol lijkt te spelen in het plan van dit nieuwe kwaad.
Ratchet and Clank vertelt het verhaal van twee onwaarschijnlijke helden die proberen een verachtelijke alien, Chairman Drek, ervan te weerhouden elke planeet in het Solana sterrenstelsel te vernietigen.