Frodo dan Sam sedang berjalan ke Mordor untuk menghancurkan Satu Cincin Kekuasaan sementara Gimli, Legolas dan Aragorn mencari Merry dan Pippin yang ditangkap Orc. Selama ini, penyihir jahat Saruman menunggu anggota Fellowship di Menara Orthanc di Isengard.

Dipimpin oleh Woody, mainan Andy hidup bahagia di kamarnya hingga ulang tahun Andy membawa Buzz Lightyear ke dunia hiburan. Karena takut kehilangan tempatnya di hati Andy, Woody berkomplot melawan Buzz. Namun, ketika keadaan memisahkan Buzz dan Woody dari pemiliknya, keduanya akhirnya belajar untuk mengesampingkan perbedaan mereka.

Pada tahun 2035, terpidana James Cole dengan enggan sukarela dikirim kembali ke masa lalu untuk menemukan asal usul virus mematikan yang memusnahkan hampir semua populasi bumi dan memaksa para penyintas masuk ke komunitas bawah tanah. Tapi ketika Cole keliru dikirim ke 1990 bukannya 1996, dia ditangkap dan dikurung di rumah sakit jiwa. Di sana ia bertemu dengan psikiater Dr. Kathryn Railly, dan pasien Jeffrey Goines, putra seorang ahli virus terkenal, yang mungkin memegang kunci kelompok nakal misterius, Tentara 12 Monyet, yang dianggap bertanggung jawab untuk melepaskan penyakit pembunuh.

Setelah membuktikan dirinya di medan pertempuran dalam Perang Perancis dan India, Benjamin Martin tidak ingin lagi melakukan hal-hal seperti itu, lebih memilih kehidupan sederhana sebagai petani. Namun ketika putranya Gabriel mendaftar menjadi tentara untuk membela negara baru mereka, Amerika, melawan Inggris, Benjamin dengan enggan kembali ke kehidupan lamanya untuk melindungi putranya.