De film draait om wat er gebeurt tijdens de periode dat Kari, de oppas, op Jack-Jack past terwijl de andere Incredibles op Syndrome’s eiland zijn. De film wordt verteld als een flashback terwijl Kari wordt ondervraagd door agent Dicker. Terwijl Kari op Jack-Jack past begint deze superkrachten te ontwikkelen. Hij blijkt te kunnen teleporteren, zweven en door muren heen lopen.
Amazone prinses Diana brengt piloot Steve Trevor terug naar de Verenigde Staten, na zijn crash op het mystieke eiland Themyscria. Tegelijkertijd moet Diana op jacht naar de uit gevangenschap ontsnapte Griekse oorlogsgod Ares. Ares, die kracht put uit oorlog en strijd, ontketent een aanval op Washington DC.
Hulk vs. Wolverine: de Hulk laat een spoor van vernieling achter zich op het Canadese platteland. Het groene monster moet gestopt worden en er is maar één persoon die dat kan, namelijk Wolverine. De elite-agent van het topgeheime Afdeling H gaat achter het spoor van de Hulk aan met maar één missie. De groene Goliath stoppen koste wat het kost. Hulk vs. Thor: Asgard, koninkrijk van de goden. Al sinds het begin der tijden heeft Loki de bedrieger naar een manier gezocht om zijn verdoemde halfbroer Thor te verslaan. Echter van alle gevechten die Thor in alle negen koninkrijken heeft gevochten, kan slechts één schepsel zich qua sterkte met hem meten. Een sterfelijk monster van Midgard genaamd The Incredible Hulk.
In de jaren 50 vinden er een aantal gebeurtenissen plaats die uiteindelijk leiden tot de begin van de Justice League. De Martian Manhunter komt aan op Aarde. Hal Jordan, een piloot, vindt een ring met speciale krachten waardoor hij de Green Lantern wordt.
Ze zijn een stuk bos aan het kappen als één van hen, Travis Walton, wordt ontvoerd door een UFO. Ze hebben grote moeite de autoriteiten van hun oprechtheid te overtuigen. Pas vijf dagen later wordt Travis weer gevonden; naakt en volledig in de war.
De familie Morris is met de auto onderweg naar een camping in de Brown Mountains van North Carolina. Maar hun GPS krijgt een storing en in plaats van de camping rijden ze nu naar een afgelegen tunnel omringd door verlaten voertuigen. Daar wordt de vader, Peter Morris, ontvoerd.
Captain Zoom is een voormalig superheld die tegenwoordig gewoon als Jack door het leven gaat. Hij wordt overgehaald opnieuw actief te worden en een groep rebelse kinderen op te leiden tot superhelden op een privé-academie.
Tijdens de Tweede Wereldoorlog ondergaat soldaat Steven Rogers vrijwillig een experiment dat hem superkrachten zou moeten geven. De proef lukt en onder het pseudoniem Captain America gaat Rogers de Nazi's te lijf. Tijdens een aanval met een experimenteel wapen wordt de Captain echter door zijn aartsvijand Red Skull ingevroren en pas in 1990 weer ontdooit. Red Skull blijkt helaas ook nog te leven en wil zelfs de president van de Verenigde Staten ontvoeren.
Goku is een jongen die een dragonball in zijn bezit heeft. Gecreëerd door een buitenaards ras en gekweekt op aarde door de machtige Piccolo. Met alle dragonballs bij elkaar, kun je een draak oproepen die vervolgens één wens vervult. De op sterven liggende grootvader van Goku heeft een laatste verzoek om met de grote Master Roshi alle dragonballs te vinden. Maar de missie is moeilijker dan het lijkt, want er zijn er maar zeven van op de wereld.