Arnold en zijn vrienden winnen een videowedstrijd waardoor ze een reis krijgen aangeboden naar San Lorenzo. San Lorenzo is echter het land waarin Arnolds ouders vermist raakte. Hij besluit om een zoektocht te beginnen om zijn ouders weer terug te vinden.
De film begint in het 2003-universum. Een gevecht tussen de Paarse Draak-straatbende en de Turtles wordt vastgelegd op film, maar wanneer deze later op tv wordt uitgezonden beweren alle vier de turtles (die uit het 2003-universum) niks af te weten van deze vechtpartij. Ze breken in bij het hoofdkwartier van de Paarse Draken om deze “dubbelgangerturtles” te vinden, maar ontdekken dat de dubbelgangers wel degelijk echte Turtles zijn.
De tienerturtles en hun mystieke ninjakrachten worden op de proef gesteld wanneer meedogenloze wezens uit een ander universum totale chaos willen veroorzaken.
Frankrijk, 1625. De jonge en onervaren boerenzoon D'Artagnan trekt naar Parijs om er een opleiding te volgen tot musketier. Door zijn vechtkunst lukt het hem om tot bij Athos, Porthos en Aramis te komen, de musketiers en vertrouwelingen van de koning.
Don Juan arriveert in het gezelschap van zijn beste vriend Loporello in Engeland. Om aan een jaloerse echtgenoot te ontsnappen laat hij zich doorgaan voor de hertog Cordoba. Wanneer hij door de echte Cordoba wordt ontmaskerd, wordt hij in de gevangenis geworpen.
Een groep Irak-veteranen is op de vlucht voor het Amerikaanse leger. Deze groep, die bekend staat als 'The A-Team', probeert zo snel mogelijk hun naam te zuiveren, omdat ze ten onrechte te boek staan als gevaarlijke criminelen. Ze worden beschuldigd van een ernstige misdaad die ze niet begaan hebben.
Big Bird wordt door een sociaal werker weggestuurd naar Ocean View in Illinois, om daar enige tijd door te brengen met zijn soortgenoten, de Dodo's. Big Bird voelt zich echter helemaal niet thuis bij de Dodo's, waardoor hij erg verdrietig is en heimwee heeft. Big Bird besluit daarom om zijn spullen te pakken en te voet terug te keren naar zijn vriendjes van Sesamstraat.