In 1985 wist de politieagent Kung Fury uit Miami een doorgedraaide arcademachine te verslaan. Dit leidde tot grote schade in de stad en Kung Fury kwam daarom in conflict met de politiechef. De politiechef wilde dat Kung Fury een partneragent kreeg.
Batman ontdekt dat hij een gewelddadige, onhandelbare, jonge zoon heeft met Talia al Ghul, Damian Wayne, die in het geheim wordt grootgebracht door de League of Assassins. Nadat Ra's al Ghul vermoord wordt door Deathstroke en zijn team de League of Assassins overneemt, zweert Damian wraak en besluit Deathstroke te doden. Zijn methodes worden echter niet goedgekeurd door Batman, wat conflicten tussen de twee veroorzaakt.
Lex Luther en zijn Legion of Doom proberen met behulp van satellieten de oceanen te bevriezen. Dit doen ze om het zeewaterniveau drastisch te verlagen, om zo nieuwe eilanden te creëren waar ze dan over willen heersen. Superman en de Justice League gaan het gevecht aan met de Legion om de satellieten te vernietigen.
Batman en Robin komen in actie wanneer Gotham City wordt bedreigd door de Penguin, de Joker, de Riddler en Catwoman. Deze keer bundelen de superschurken hun gezamenlijke talenten om het dynamische duo het leven zuur te maken.
Mr. Freeze en de Penguin breken in Arkham Asylum. Ze zetten hun nieuwste plan in werking en veranderen Killer Croc, Bane en andere schurken in enorme monsters. Zij laten vervolgens een spoor van vernieling achter in Gotham City.