In 2029 is de mutant bevolking aanzienlijk geslonken en de X-Men zijn ontbonden. Logan zijn vermogen om zichzelf te genezen is slinkende en hij ontfermt zich nu samen met de mutant Caliban over de zieke Professor X in een schuilplaats op de grens met Mexico.
The Avengers zijn een buitengewoon team van superhelden. Wanneer een onverwachte vijand opduikt die een bedreiging vormt voor de wereldwijde veiligheid heeft Nick Fury, directeur van de internationale vredesmacht S.H.I.E.L.D., een team nodig om de wereld te redden van de ondergang.
Wanneer een nieuwe dreiging in Gotham alle experimentele technologieën begint te stelen, wordt Batman op de hoogte gebracht. Maar hij is niet de enige die interesse toont in dit probleem: ook de Teenage Mutant Ninja Turtles - broers Leonardo, Donatello, Raphael en Michelangelo - mengen zich in het gevecht.
De machtige, maar arrogante krijger Thor wakkert met zijn roekeloze acties een eeuwenoude oorlog aan. Thor’s vader Odin verbant Thor naar de Aarde en hier wordt hij gedwongen tussen de normale bevolking te leven. Hij wordt verliefd op de jonge wetenschapper Jane. Terwijl zij een relatie ontwikkelen op Aarde beseft Thor wat het vergt om een echte held te zijn wanneer zijn aartsvijand duistere krachten van Asgard naar de Aarde stuurt.
Een groep studenten van de Cosmo Academie staat op het punt om voor hun laatste examen op te gaan: vijftig dagen overleven op een oud vervallen ruimteschip. Na aankomst merken zij dat er één persoon te veel onder hen is, in plaats van tien studenten zijn zij nu met elf personen. Wie is de oplichter, wie hoort er niet bij hen en waarom is hij of zij daar?
Een vernielzuchtige slechterik, die zichzelf voordoet als Batwoman, zaait dood en verderf in Gotham City. Als blijkt dat de slechterik werkt in opdracht van The Penguin, gaat de echte Batwoman achter hem aan. Helaas wordt ze in de val gelokt en gekidnapt door Penguins rechterhand Bane, en de enige die haar nu nog van een gewisse dood kan redden is Batman.
Nu de X-Men succesvol het verleden veranderd hebben en een veilige toekomst voor de mutanten hebben bereikt, keert uit de duisternis de eerste mutant terug: Apocalypse. Deze mutant, ook wel En Sabah Nur genaamd, ziet de hedendaagse mutanten als zwak.
De piloot Cliff vindt een rocketpack dat de drager in staat stelt te vliegen. Neville Sinclair heeft zijn zinnen gezet op de rocketpack, en is van plan om het aan de Nazi's te geven. Om dit voor elkaar te krijgen probeert hij Cliffs vriendin Jenny te pakken te krijgen, om vervolgens te kunnen ruilen.
De Romeinen willen hun rijk uitbreiden. Het lijkt erop dat de Galliërs meer problemen dan gebruikelijk hebben om weerstand te bieden aan de soldaten van Caesar, nu Panoramix zijn geheugen kwijt is nadat hij een menhir op z'n kop heeft gekregen. Obelix heeft per ongeluk een menhir op het hoofd van de druïde Panoramix gegooid. Panoramix is daardoor stapelgek geworden en kan zich het recept van de toverdrank niet meer herinneren. Dan krijgt het dorp, onbeschermd door de toverdrank, bezoek van een Ziener die handig inspeelt op de grootste angst van de Galliërs,namelijk dat de hemel op hun hoofd zou kunnen vallen. Er ontstaat angst en twist onder de anders zo onverschrokken dorpelingen. Tot overmaat van ramp krijgen ook de Romeinen daar lucht van.
Een tiental jaar geleden voerde David Banner een geheim experiment uit op genetisch materiaal. Door een panne onderging dokter Banner per ongeluk een mutatie. Hij verandert in een groene krachtpatser, de Hulk, telkens als hij met agressie wordt geconfronteerd. Om zichzelf en zijn medemens te beschermen, leidt hij sindsdien een teruggetrokken bestaan. Een vroegere studiegenoot, Donald Blake, is op de hoogte van dat mislukte experiment en begint een zoektocht naar de dokter. De reden hiervoor is dat hij enkele jaren geleden getroffen werd door een blikseminslag en hij sindsdien de geest en het lichaam van de Scandinavische krijgsheer Thor kan oproepen. Donald ziet deze gave als een last en hij wil David overtuigen onderzoek te voeren om die ongekende krachten voor eens en voor altijd te begraven.
Tijdens het feest der doden in Los Angeles zijn hij en zijn zoon getuige van een executie, en ze moeten dit met de dood bekopen. Een kraai brengt hem echter terug naar zijn vriendin Sarah, die hem vertelt dat hij moet uitzoeken wie er achter hun dood zat. Het spoor leidt naar een drugdealer en zijn excentrieke topman.
Garfields 29-jarige winning streak in de jaarlijkse Fun Fest-talentenwedstrijd wordt bedreigd door een onstuimige nieuwkomer, Ramone, die over grote charme beschikt. Bezorgd dat hij zijn gave zal verliezen, gaat Garfield op zoek naar de mythische vijver van Freddy Frog, waar wordt gezegd dat iedereen die ervan drinkt zeker grappig zal zijn.
Kolonel Nick Fury is na het einde van de Koude Oorlog vrijwillig in ballingschap gegaan in het onherbergzame Ykongebied. Hij heeft genoeg van zijn werk als geheim agent bij S.H.I.E.L.D. en beschouwt zijn opdracht als voltooid nadat hij aartsvijand baron Wolfgang Von Strucker van misdaadorganisatie Hydra heeft uitgeschakeld. Vijf jaar later blijkt Hydra echter nog steeds actief te zijn. De bende staat nu onder leiding van de wrede Viper Von Strucker, Wolfgangs dochter. Zij is erin geslaagd een dodelijk virus te creëren en dreigt ermee Amerika te vernietigen. S.H.I.E.L.D. doet opnieuw een beroep op Nick Fury.
Tijdens een ruimtemissie worden Reed Richards, Sue Storm, Ben Grimm en Johnny Storm blootgesteld aan een kosmische straling. Hierdoor krijgen ze allemaal speciale superkrachten. Maar al snel krijgen ze het aan de stok met de verminkte Dr. Doom. Wat de helden echter niet weten is dat Reed Richards een vroegere vriend van Dr. Doom was en dat hij er onopzettelijk voor gezorgd heeft dat zijn gelaat werd verminkt.
Superman, een jonge verslaggever in Metropolis, begint aan een reis om zijn Kryptonische afkomst te verzoenen met zijn menselijke opvoeding als Clark Kent.