Japan wordt aangevallen door Godzilla, die na zijn mislukte aanval van vijftig jaar geleden op wraak zint. Godzilla is bestand tegen praktisch alle conventionele wapens, en uiteindelijk lijkt Godzilla alleen te verslaan door drie heilige monsters, die tot leven worden gewekt door de aanbidding van de zielen van in de tweede wereldoorlog omgekomen Japanse soldaten.

Het verhaal speelt in de toekomst (1964) wanneer bijna al het leven op aarde is vernietigd door de radioactiviteit van een nucleaire holocaust. Alleen Australië is gespaard gebleven, maar het is slechts een kwestie van tijd voor ook zij de radioactiviteit zullen ondervinden.

Codenaam: Seabat. De gevaarlijkste onderzeeër ooit gemaakt. Explosief nucleair en bemand door een bemanning die officieel dood is, is de Seabat het meest bewaakte militaire geheim ter wereld. En het is op het verkeerde pad gegaan.

Een Japanse kapitein krijgt tijdens de Tweede Wereldoorlog de opdracht om zijn land te beschermen tegen een mogelijke derde aanval met atoomwapens. Daarvoor krijgt hij van de regering het commando over de meest geavanceerde duikboot uit de geschiedenis: de Lorelei. De duikboot heeft een geheim wapen aan boord waarmee de vijand in een klap kan worden uitgeschakeld.

Een reusachtig monster wordt in zijn slaap gestoord als er in zijn buurt radioactief afval wordt gestort. Het beest is eveneens radioactief en het leger probeert hem met alle mogelijke middelen te stoppen voor hij heel Engeland besmet

Dan Leland, wordt gestuurd om gerapporteerde waarnemingen te onderzoeken van een gigantisch inktvisachtig beest dat de hele bevolking van een vissersdorpje op scherp heeft gezet. Hoewel Leland zijn reis begint met het vertrouwen dat dit zeedier met een onverzadigbare eetlust het spul is van oude legendes, begint een reeks gruwelijke gebeurtenissen hem al snel van gedachten te doen veranderen.

Het jaar is 1903. Een groep duikers ontdekt een onderwaterstad waar een smokkelaarsbende leeft. De boeven worden nooit ouder en zijn er zelfs in geslaagd om een aantal vis-mannen tot hun slaven te maken.

Herbert West heeft totaal de controle verloren op de campus en steekt zijn gloeiende groene reagens in elk lijk dat hij kan vinden!

De beruchte terrorist Milo Gorack wordt gearresteerd door CIA-agent John Turner en via een geheim transport via onderzeëer naar de VS gestuurd. Als de onderzeëer aangevallen wordt door een enorme gemuteerde octopus, weet Gorack in de chaos te ontsnappen. Een uitermatend spannend kat-en-muis spel tussen Turner en Gorack begint, maar als de enorme tentakels een gat in de romp van de duikboot slaan, begint de ellende pas echt.

Nadat Andy Flynn Sharktopus (een half haai- half octopus schepsel) heeft vernietigd drijven zijn resten in de oceaan. Er is echter een eicel bewaard gebleven en de marinebioloog Lorena besluit de nakomeling groot te brengen in het aquarium van haar oom. Ondertussen werkt dokter Rico Symes aan zijn eigen biologische wapen. Met behulp van het DNA van een Pterodactylus en een barracuda creëert hij een monster dat zowel het land, de lucht als de zee kan terroriseren. Alles gaat volgens plan, totdat het schepsel wordt ontvoerd door een corrupte ingenieur die het probeert te verkopen aan de hoogste bieder.