Nogle år ude i fremtiden er James Howlett, alias Logan eller Wolverine, langsomt ved at blive slået ihjel af sit adamantiumskelet, der før gjorde ham usårlig. Logan bor med sin syge mentor, Charles Xavier, og mutanten Caliban langt ude på bøhlandet, men der bliver alligevel ballade, da en ung pige, Laura, dukker op forfulgt af svært bevæbnede mænd. Laura viser sig at have evner, der forbinder hende til Logan.

Golfkrigen, 1991. Jack Starks overlever et pistolskud i hovedet, men får hukommelsestab. Og da han efter hjemkomsten til Vermont bliver beskyldt for mord, er der intet, han kan gøre… Han bliver indlagt på en lukket afdeling og udsat for en ny, kontroversiel behandlingsform. Stærkt påvirket af hallucinogene stoffer rejser han ud i fremtiden, hvor han møder Jackie. Hun gemmer på nøglen til den mørke fortid, Jack ikke kan huske… Og da hun opdager, at Jack er fire døgn fra sin dødsdag, må de sammen prøve at undgå det uundgåelige…

Efter et fejlslagent eksperiment opdager en videnskabsmand at han måske er den eneste mand tilbage på jorden.

I 30'ernes USA elsker Daniel Helen men kan ikke få det sagt, inden hun bliver ramt af en lastbil. I sorg melder Daniel sig til et eksperiment og bliver fosset ned. Da han vågner i 90'erne har verden ændret sig og Daniel er forvirret og svag. Ingen kender længere til eksperimentet men heldigvis finder han husly hos den søde Claire