In het dorpje Shemoto heerst een epidemie waaraan alle inwoners sterven. In opdracht van clanleider Chamberlain gaat een aantal leden van de Koga Ninja Clan naar het dorp om te onderzoeken wat er aan de hand is. In de buurt van het getroffen dorp wordt de groep in het bos aangevallen en op gruwelijke wijze afgeslacht door een aantal merkwaardige en oersterke wezens.
Twee rivaliserende Ninja's, een Japanse en een Chinese, worden gedwongen samen te werken, wanneer hun meester door een sterke tegenstander wordt vermoord.
De film opent met een voorspelling dat Naruto Uzumaki sterft terwijl hij vecht tegen een monster dat hem doodt. Een begrafenis wordt gehouden voor Naruto in zijn thuisdorp, waar anderen aanwezig zijn. Tsunade kijkt uit naar het raam en denkt na of alles gewoon door het lot is besloten.
Naruto en zijn vrienden Sasuke en Sakaru mogen, onder leiding van hun meester Hatake Kakashi een 'A-rank' missie uitvoeren, die eruit bestaat de veiligheid van de sneeuwprinses te garanderen.
Vier gemuteerde schildpadden hebben van een rat die Ninja-technieken beheerst de Oosterse kunst geleerd. Ze leven in de riolen van de stad. De eerste mens die ze te zien krijgt is de verslaggeefster April. De schildpadden sluiten vriendschap met haar en helpen een handje in de strijd tegen een golf van misdaad in de stad, waar de organisatie Foot achter steekt.
Snake Eyes wil een van de elite-moordenaars van de Arashikage-clan worden, maar de weg naar deze kringen is niet eenvoudig. De moordenaars van de Arashikage-clan nemen klussen aan die niemand anders durft te doen. Snake Eyes is vastbesloten om met zijn leraar Hard Master te trainen om zijn doel te bereiken...
Cho Osaki, een beoefenaar van de ninjitsu-krijgskunst, verlaat zijn geboorteland Japan om komaf te maken met zijn gewelddadige leven. Maar na zijn vertrek met zijn zoon naar Amerika ondervindt hij al snel dat hij zijn verleden en zijn lot niet kan ontlopen. Luitenant Jack van de politieafdeling van Los Angeles onderzoekt verscheidene drugsmoorden. Jack zoekt daarom raad bij de karate-instructeur van het politiedepartement. Die stuurt hem echter naar zijn goede vriend Cho Osaki. Met de nodige gevolgen...
De Turtles komen erachter waar de Ooze, het middel dat Turtles van ze heeft gemaakt, vandaan komt. Maar ook Shredder komt er achter, en gebruikt het om zichzelf machtiger te maken. En dus moeten de Teenage Mutant Ninja Turtles weer eens laten zien wie sterker is.
De Amerikaanse soldaat Joe Armstrong, zeer bedreven in Oosterse vechttechnieken, probeert in zijn eentje een groep huurlingen op de Filipijnen te overmeesteren.
De beste strijders, de Mortals, gaan het gevecht aan met het kwaad in het afschrikwekkende koninkrijk 'Outworld'. De inzet is niets minder dan het lot van de wereld en al haar bewoners. De drie Mortals worden uitgenodigd door Shang Tsung voor de tiende Mortal Kombat en onder de leiding van de machtige dondergod Rayden leren ze hun eigen innerlijke angst te overwinnen. Wanneer de vierarmige prins Goro dit toernooi zou winnen, raakt de aarde voor eeuwig ondergedompeld in een grote duisternis. Maar de Mortals hebben een geheim wapen, de beeldschone prinses Kitana. Maar zullen zij erin slagen de rust en vrede op 'Outworld' te herstellen?
April wil van haar vakantie genieten maar gaat eerst nog even met cadeau's langs bij Splinter, de rat, en de vier schildpadden. Tussen haar cadeaus zit ook een scepter met een eigenaardige inscriptie. Als ze deze voorleest verdwijnt ze naar het Japan anno 1303 en verschijnt er een prins uit die tijd in haar plaats bij de Turtles.
Nadat z'n training op de ninja-academie is voltooid, reist de oorlogsveteraan Cole naar de Filipijnen en komt vervolgens in conflict met een landeigenaar die aast op het landgoed van Cole's vriend. Cole komt ook in aanraking met z'n grootste rivaal van de academie.
Dead or Alive is een jaarlijks martial arts toernooi waar alleen de beste vechters van de wereld welkom zijn. De Japanse prinses Kasumi wordt dit jaar uitgenodigd. Dit geeft haar een perspectief om de schijnbare dood van haar broer te onderzoeken, die bij het vorige toernooi verdwenen is. Andere genodigden zijn o.a. Tina, een worstelaarster die wil bewijzen dat ze meer kan dan dat, Christie, een inbreekster, en Helena, de dochter van de vorig jaar overleden DOA-baas. Zij zullen samen met de wereldtop van alle vechtklasses strijden om de titel en het prijzengeld. Gebaseerd op het gelijknamige spel.
Een groep strijders heeft zes dagen de tijd om de wereld te redden van de duivelse Shoa Kahn. Als ze hem en zijn strijders niet verslaan tijdens het tournooi Mortal Kombat zal de Aarde worden samengevoegd met Outworld, en zal Kahn de ultieme machthebber worden
April, Courtney en Monica zijn drie mooie, intelligente en stoere eerstejaars studenten. Op het Los Lomas Malas college zijn ze bezig met hun examens, om zo toegang te krijgen tot een belangrijke universiteit. Ook moeten ze hun schoolteam aanmoedigen en hun Sensei redden, die is ontvoerd door de maffia.