El 1943 els nazis, exasperats pel nombre de fugues de les seves presons per un nombre relativament petit de presoners aliats, decideixen traslladar-los a tots a una presó d'alta seguretat "a prova de fugues" durant la resta de la guerra. Els presos no triguen a traçar el pla d?un dels intents de fuga més ambiciosos de la Segona Guerra Mundial. Basat en una història real.

L'espectacular batalla entre els Evangelion, les màquines de combat definitives creades per la humanitat, i les insondables entitats conegudes com a Ángeles s'intensifica fins a aconseguir el punt de ruptura a partir del qual ja res tornarà a ser com abans. Sota l'incessant ataqui invasor, l'agència NERV activa dues noves unitats d'Eva pilotades per la misteriosa Mari Illustrious Makinami i l'agressiva Asuka Langley Shikinami.

George Taylor forma part d'una tripulació d'astronautes a bord d'una nau espacial -en una missió de llarga durada- que s'estrella en un planeta desconegudament i aparentment sense vida intel·ligent. No obstant això aviat es dóna conta que el lloc està governat per una raça de simis intel·ligents que esclavitzen els éssers humans, que no tenen la facultat de la parla. Quan el seu líder, el doctor Zaius, descobreix amb horror la facultat de parlar de Taylor, decideix que el millor és exterminar-lo.

Un devastador terratrèmol redueix Seül a runes, amb l’excepció d’un sol gratacel, que presideix el centre de la ciutat.

La lluna controla les nostres nits, els nostres dies, les estacions i les marees oceàniques. Des del començament de la humanitat, les seves fases s’han mantingut com un símbol d’il·luminació, de coneixement intern i de la nostra pròpia immortalitat. Fins ara. Una força misteriosa colpeja a la Lluna i l’envia en xoc directe contra la Terra.