פארודיה רשמית של סקובי-דו על פרויקט המכשפה מבלייר.
פרופסור שמלמד באוניברסיטה פותח מגילה אסורה ובעקבות זה רוח רפאים יפנית של הרעם והברק משתלטת עליו, הרוח רוצה לשלוט בעולם שלנו. המחלקה לחקר האל טבעי שולחת את הלבוי וקבוצה של סוכנים לחקור את המקרה, אבל שהלבוי מרים חרב סמוראית, הוא משוגר לעולם האגדות היפני, העולם הזה מאוכלס ע"י רוחות ומפלצות. בינתיים, הסוכנים קייט קוריגן וראסל טרון הולכים בעקבות הרמזים ומנסים לאתר את הפרופסור כדי שיעזור להחזיר את הלבוי לעולם שלנו.