Un home amnèsic és rescatat per la tripulació d'un vaixell pesquer italià quan sura la deriva al mar. Manca d'identitat i de passat, però té una sèrie de talents extraordinaris en arts lingüístiques, marcials i d'autodefensa que suggereixen una professió de risc. Confús i desorientat, emprèn una recerca frenètica per descobrir qui és i per què la seva vida ha pres un gir tan perillós.
Una cabina telefònica és l'instrument que utilitzen Billy i Ted per viatjar a gust per l'espai i el temps. Viatjaran a l'Infern, al Cel, es faran amics de la Mort (que acabarà convertint-se en ídol del rock), i coneixeran els marcians, el conill de Pasqua, i Albert Einstein.
Al Japó, al segle XVII. Quatre samurais persegueixen el príncep Kenshin que s'ha amotinat contra el seu pare. Detingut i empresonat, Kenshin agafa un ceptre. Dels nostres dies, a Nova York, la periodista April O'Neil, ha vingut a oferir als seus amics Leonardo, Donatello, Raphael, Michelangelo i Splinter el mateix ceptre que ha trobat en un antiquari. Mentre que en llegeix la inscripció, desapareix i Kenshin apareix en el seu lloc. Les quatre tortugues Ninja tornen al segle XVII per lliurar April i ajudar la princesa Mitsu a resistir a la invasió de les tropes del rei Norinaga. Seran ajudats per un jove pirata Whit Whitley, l'avantpassat de Casey Jones…