Cowboy Woody is al jaren het favoriete speelgoed van Andy. Wanneer de jongen voor zijn verjaardag de blitse astronautenpop Buzz Lightyear krijgt, wordt Woody naar de achtergrond verdrongen. De twee stukken speelgoed wedijveren om de gunst van de jongen en zetten door hun geruzie de hele kinderkamer in rep en roer. Als Buzz door toedoen van Woody uit het raam valt, krijgt Woody hiervan de schuld van de rest van het speelgoed. Hij gaat naar buiten om Buzz proberen te redden.
Overstelpt door haar verstikkende schema, gaat de door Europa rondreizende prinses Ann er voor een nacht vandoor wanneer ze in Rome is.
De slechte heerser van Duloc (de kleine Lord Farquaad) heeft alle sprookjesfiguren uit zijn land verbannen. De figuren, inclusief een praatgrage ezel, vluchten naar het moerasland van de oger Shrek, die erg op z'n privacy gesteld is.
Aladdin is een straatjongen die samen met zijn aapje Abu in Agrabah woont. Als Prinses Jasmine het leven in het paleis zat wordt, besluit ze zich onder het volk te mengen. Ze komt Aladdin tegen, en hij wordt verliefd op haar.
Terwijl Andy op zomerkamp is, ziet speelgoedverzamelaar Al McWiggin Woody liggen in de tuin en besluit hem mee te nemen. Al snel wordt Woody gemist door zijn kameraad Buzz Lightyear, die een reddingsactie op touw zet. Voor het eerst moeten de speelgoedvrienden de echte wereld verkennen om Woody te redden.
Omdat de populaire cartoonster Roger Rabbit denkt dat zijn mooie vrouw Jessica vreemdgaat, huurt de studio privé-detective Eddie Valiant in om de zaak te onderzoeken. Valiant ontdekt vervolgens dat er inderdaad iets aan de hand is tussen Jessica en de succesvolle ondernemer Marvin Acme. Als Acme dan plotseling dood wordt gevonden, is Roger de voornaamste verdachte en wordt hij opgejaagd door de Judge Doom. Roger besluit om hulp te zoeken bij Valiant, die moet proberen de onschuld van het konijn te bewijzen.
In het Tokio van begin jaren 60 voeren militaire contra-spionagetroepen strijd tegen een sterk georganiseerde ondergrondse beweging van subversievelingen en terroristen. Tijdens een anti-terroristische actie betrapt geheimagent Kazuki een zelfmoordterroriste.
Een heldhaftige versie van Lex Luthor uit een ander universum vraagt de Justice League om hulp om zijn Aarde te redden van de Crime Syndicate; een kwaadaardige versie van de Justice League. Wat volgt is een strijd tussen goed en kwaad, die beide planeten in gevaar brengt.
Na teruggekeerd te zijn van hun huwelijksreis horen Shrek en Fiona dat haar ouders van het huwelijk gehoord hebben. Ze willen niets liever dan haar ware liefde te ontmoeten in hun koninkrijk Far Far Away. Ze zijn zich echter niet bewust van de veranderingen die hun dochter onlangs ondergaan heeft. En dat hun nieuwe schoonzoon een 350 kilo zware Ogre met een slechte hygiëne is en een pratende ezel als vriend heeft.
Jack Burton is een stoere vrachtwagenchauffeur, die zijn vriend Wang helpt om diens vriendin terug te vinden. Hij komt terecht in Chinatown, maar tot zijn grote verbazing gebeuren daar enkele vreemde dingen. Hij en Wang moeten zich een weg banen door bovennatuurlijke krijgers om Lo Pan te verslaan, die Wangs vriendin wil offeren om zo zijn sterfelijkheid terug te krijgen.
In de kerkers van het kasteel van de boze tovenares Bavmorda geeft een gevangene geboorte aan een baby, die volgens de legendes een eind zal brengen aan de duistere tijden van de slechte koningin.
Stanley Ipkiss is een bankmedewerker die constant wordt vernederd bij confrontaties, en niet voor zichzelf durft op te komen. Na één van de ergste dagen uit z'n leven vindt hij een masker. Wanneer hij het masker opzet komt zijn binnenste ik boven: een cartoon-achtige, romantische en wilde man. Een misdaadbaas gaat achter Ipkiss aan, nadat een vriend van hem dankzij hem de dood vindt.
Vroeger, toen draken nog leefden, was het altijd verstandig om ze te vriend te houden. En net als bij de man, gaat ook bij een draak de liefde door de maag. Een koning houdt regelmatig een loting onder alle maagden in zijn rijk. De maagd die wordt uitgeloot zal worden geserveerd aan de draak, om hem weg te houden uit het koninkrijk. Het is aan een magiër en zijn hulpje om de draak te doden.
Shrek en Fiona zijn waarnemend koning en koningin. Ze vinden er maar niets aan, dus gaat Shrek samen met Donkey en Puss In Boots op zoek naar de ware troonopvolger. Dat blijkt een neef van Koningin Lillian te zijn, Artie, die op kostschool zit en totaal geen interesse heeft in het koningschap. Terwijl Shrek weg is, is Prince Charming bezig met een staatsgreep om Far Far Away over te nemen.
De wees Keegan wordt opgevoed door zijn grootouders in Ierland. Hij geniet van de tijd die hij doorbrengt met zijn opa. Hij beheert de plaatselijke vuurtoren en verlicht 's nachts de rivieren om het pure kwaad van een jager af te wenden. Hij is op zoek naar een manier om terug te keren en het magische gewei van een geesthert te verzamelen. Keegan gelooft echter niet in zulke onzin en is diepbedroefd als zijn opa overlijdt, waardoor hij de bewaarder van de vuurtoren wordt. Als Keegan tijdens zijn eerste dienst het licht niet aandoet, begint de jager met zijn missie. Samen met zijn beste vriendin Moya moet Keegan het magische land bezoeken waar de geestherten leven en de jager tegenhouden.
Lilli is een doodnormaal 10-jarig meisje. Dit verandert wanneer er zomaar uit het niets een magisch boek in haar kamer verschijnt, samen met zijn begeleider Hector (een onhandig draakje). Surulunda, een geheime tovenares uit de magische wereld, heeft Lilli gekozen als haar opvolgster en Hector gestuurd om alles uit te leggen aan Lilli. Lilli moet namelijk binnen 99 uur bewijzen dat ze een waardige opvolger is. Het magische boek brengt verschillende spannende avonturen met zich mee, maar ook een gevaarlijk avontuur met de boosaardige tovenaar Hieronymus, die de wereld over wil nemen. Lilli zal de confrontatie met hem aan moeten gaan.
Samen met de dappere krijger Kor bindt de jonge Simon de strijd aan met de slechte tovenaar Shurka, die het koninkrijk Axeholme onder zijn heerschappij heeft gebracht.