Dette er historien om, hvordan Ash og Pikachu først mødtes. I første omgang var Pikachu ulydig overfor Ask, men Ash ønskede kun at være venner med Pikachu. På den dag de stod ud fra Palletbyen, så de begge en Ho-Oh flyvende og de lavede et løfte om at møde det.
Ash Ketchum må sætte sine evner på prøve, når han forsøger at redde verden fra undergang. Den Greedy Pokemon samler Lawrence III kaster universet i kaos efter at forstyrre balancen i naturen ved at erobre en af de Pokemon fugle, der udgør de elementer af ild, lyn og is. Vil Ash har hvad det kræver at redde verden?
Ash, Pikachu og hans venner forsøge og stoppe et par tyve gemmer sig ud i kanalerne og gyder i Alto Mare, det gamle vand kapital. Vær med i eventyret er to nye legendariske Pokémon , et søskendepar opkaldt Latias og Latios , der tjener som fredsbevarere og beskyttere af Soul Dew - en uvurderlig skat med en mystisk magt.
Satoshi og hans venner rejser til LaRousse, hvor de møder en dreng ved navn Tooi der er bange for Pokemon på grund af en hændelse, der skete fire år tidligere. I mellemtiden, Deoxys, en Pokémon fra rummet, er opstået, sætte en barriere rundt i byen og kidnapning mennesker. Rayquaza, en Pokémon, der lever i atmosfæren, kommer til at bekæmpe den.
I en hylende tropeorkan bliver Robinson Crusoes skib smadret til pindebrænde. Som eneste overlevende kaster bølgerne ham op på stranden på en lille øde ø. Her starter hans overlevelseskamp for alvor. Junglen, ensomheden og den evige kamp for føde er lige ved at knække ham. Men endelig bliver hans bønner hørt. Øen får besøg af andre mennesker. Kannibaler. Det lykkes for Robinson Crusoe at skræmme kannibalerne væk fra øen og redde deres fange fra den pinefulde, rituelle død. Fredag, som Crusoe døber den unge mand, kommer fra en nærliggende ø. Langsomt bliver de to mænd fortrolige og opbygger et solidt venskab. Men kannibalerne har ikke glemt ydmygelsen. I stort tal vender de tilbage for at få hævn.
Da Edward Carnby var barn, så han noget, som var umuligt at forklare. Nu, tyve år senere, forsker Edward i det overnaturlige. Og han er på vej ind i sit livs farligste sag. 19 mennesker er allerede forsvundet. Og de har alle haft én ting til fælles: de er vokset op på samme børnehjem som Edward! Sammen med antropologen Aline Cedrac vikles Edward ind i en sag om oldgamle ondskaber, fortabte civilisationer, hemmelige konspirationer og overnaturlige kræfter, der truer hele menneskeheden! Er du nogensinde vågnet op midt om natten og har følt, at der var nogen i rummet hos dig? Du leder panisk efter natlampen, men idet du tænder, kan du intet se. Du føler dig sikker... men at du ikke kan se noget betyder ikke, at det ikke er der...