Tror du på havfruer? Hvis ikke, så kommer du til det, når du har set dette magiske undervandseventyr med Sofia den Første. Sofia møder den lille havfrue Oona, og så giver amuletten Sofia mulighed for, at hun kan forvandle sig til en havfrue og besøge sin nye vens undervandsrige. Men begge verdener kommer i fare da undervandsuhyret Cedric stjæler Oonas magiske havfruekam. Sofia skal nu ud på et eventyr for at redde Oona og forhindre en tyfon inden det er for sent.

Uhyret er blevet fanget af videnskabsmænd, der vil gøre alt for at afsløre hans hemmeligheder. Begrænset til et akvarium i fangenskab finder uhyret kun én kilde til sympati - Helen, en smuk kvindelig forsker. Da uhyret i sidste ende flygter fra hans fangenskab, kidnapper han Helen, opsat på at tage hende med til hans undervandshule.

Efter myndighederne gentagne gange undlader at lytte til hans advarsler om, at en katastrofal oversvømmelse er nært forestående, beslutter en videnskabsmand selv at handle ved at bygge en gigantisk ark. Pludselig bliver advarslerne til alvor, og hele situationen ændres på dramatisk vis.