Després d'establir-se a Green Hills, en Sonic es mor de ganes de demostrar que té fusta d'autèntic heroi, però en Robotnik torna amb el nou company Knuckles i busca una maragda que té el poder de destruir civilitzacions. En Sonic no estarà sol, l'ajudarà en Tails.

En aquesta tercera part de la saga, en Po ha de fer front a dos reptes: un, d'origen sobrenatural; l'altre, molt proper, quan apareix un ós panda que diu que és el seu pare. O sigui, que té dos pares i una colla de parents que li recorden qui és.