داستان فیلم در مورد زنی است به نام سامانتا. او برای دختر هشت ساله اش یک مادر ایده آل از هر نظر است. آنها زندگی آرامی دارند و سامانتا هم مشغول تدریس در یک مدرسه است. اما این روند آرام زندگی به هم میخورد. زیرا ضربه ای به سر سامانتا میخورد و او گذشته ی خودش را دوباره به یاد می آورد. به یاد می آورد که او یک مامور مخفی و بسیار با مهارت بوده است. و به زودی متوجه میشود که شخصی اجیر شده است تا او را بکشد و ...
گروهی شبه نظامی به نام “E.S.W.A.T” در آرمان‌شهری به نام “المپوس” به همراه انسان‌ها، سایبورگ‌ها و انسان‌های مهندسی شده تلاش می‌کنند زندگی کاملی در کنار یکدیگر داشته باشند. اما تعدادی حمله تروریستی که توسط سایبورگ‌ها و انسان‌ها انجام میشود شهر را دچار آشوب می‌کند…
یک واحد نظامی و فوق سری که متشکل از نخبگان برای عملیاتی مخصوص، معروف به جی آی جو تشکیل شده است. در این هنگام گروهی تبهکار به سردستگی یک دلال مخوف اسلحه دست به اختشاش می زند ...
"دنی اونیل" متخصص مواد منفجره ای است که مسئول پرونده ای می شود که در آن تروریتستها موفق به ساخت مواد منفجره مایعی شده اند که به وسیله بدن انسان فعال می شود.هدف آنها یکی از سناتورهای آمریکا است که با همسر"دنی" رابطه پنهانی دارد...