Het is 2034, twee jaar nadat Motoko Kusanagi Section 9 heeft verlaten. Togusa is de nieuwe leider van een nu aanzienlijk groter team. Sectie 9 wordt geconfronteerd met een serie van ingewikkelde incidenten waar een hacker genaamd "Puppet Master" voor verantwoordelijk blijkt te zijn.
Film bestaat uit twee delen en begint in 2004. Tien maanden na de Moord op Yan, wordt Ming gedegradeerd tot een kantoorfunctie in afwachting van een intern onderzoek. Ondertussen maakt de jonge Yeung vliegensvlug carriere binnen de politiemacht. Dit doet Ming denken aan zijn eigen loopbaan die voor de dood van Yan ook voortvarend liep. Ming verdenkt Yeung ervan dat hij, net als hemzelf, op de loonlijst staat van de triade en gaat op onderzoek uit. 2001. Na twee jaar als undercover actief te zijn binnen de organisatie van Sam, begint Yan eindelijk zijn vertrouwen te winnen. Zijn eerste missie is het opstarten van een smokkelnetwerk met Shen, een mysterieuze zakenman uit China.
De toppers van het politiecorps van Hong Kong worden ingezet om een vrouw te beschermen die op de hitlijst staat van clanbaas Lau. De eerste killers zijn al onderweg en Muscles en zijn partner proberen uit alle macht Lau tegen te houden.
Vier decennia geleden was Laurie Strode nipt ontsnapt aan de moordpartij op Halloweennacht door Michael Myers. De gemaskerde figuur die haar achtervolgd heeft is weer teruggekeerd. Laurie maakt zich op voor een laatste confrontatie met hem.
Detective Harry Callahan, beter bekend als 'Dirty Harry', is een moordenaar op het spoor die zijn slachtoffers op rituele wijze om het leven brengt. Hij wil de gangster absoluut inrekenen en neemt een loopje met de reglementen. Zijn oversten pikken dit niet en sturen Callahan naar San Paulo, een plaatsje ten noorden van Californië. Ook hier wordt hij niet warm onthaald.
Winnie de Poeh, Knorretje, Uil en Teigetje besluiten de strijd aan te gaan in de stad Ashdown, de thuisbasis van Christopher Robin, en laten een bloedig spoor van dood en chaos achter.
Als de huishoudster van architect Kersey wordt aangevallen, verkracht en vermoord en ook zijn dochter niet levend uit de handen van de bende komt gaat hij weer op wraaktocht, deze keer niet in N.Y. maar in L.A.
Dankzij Harry Callahan komt een gangster in de gevangenis, maar plaatst zichzelf door deze actie als achtste naam op een dodenlijst (Op deze lijst staan eigenlijk alleen maar beroemdheden maar wanneer Callahan erop komt wordt het pas interessant). Mensen mogen inzetten op wie ze denken dat het laatste in leven zal zijn.
Als Bennie uit de gevangenis komt, hoort hij dat zijn zieke pleegvader nog een laatste wens heeft: hij wil zijn biologische zoon Koen ontmoeten. Nadat Bennie Koen heeft opgespoord, besluiten ze samen het leven van hun vader te redden door een geldtransport te overvallen om zo een nieuwe lever voor hun (pleeg)vader te bekostigen. Helaas gaat dit niet helemaal zoals gepland...
In de criminele onderwereld van Detroit worden de straten overspoeld met geweld en drugs en de corruptie beïnvloedt de levens van velen. Voor Lino (David Belle) is elke dag een strijd voor een eerlijk leven. Maar wanneer een drugsbaron zijn vriendin ontvoert, leidt dat tot de samenwerking met Damien Collier (Paul Walker), een undercover agent die de betrokkenheid van de drugsbaron in iets veel ergers onderzoekt - een plan om de hele stad te verwoesten.
Veroordeeld tot levenslang voor een bankoverval die hij niet heeft gepleegd, slaagt Jack Hammond er tijdens een onbewaakt moment in uit de gevangenis te ontsnappen. Alles gaat goed tot hij bij een benzinestation twee agenten opmerkt, die toevallig in de buurt zijn. Paniek maakt zich meester van Jack. Hij gijzelt de knappe Natalie en slaat met haar op de vlucht in haar supersnelle rode sportwagen. Het hele politiekorps, met in één van de wagens een televisieploeg, zet onmiddellijk de achtervolging in. Boven de rode BMW circelt ook een nieuwshelikopter. Tijdens de wilde rit en in alle chaos leren Jack en Natalie elkaar beter kennen. Het blijkt dat zij de dochter is van een rijke industrieel, die niets of niemand zal sparen om haar weer heelhuids terug te krijgen.
Darkman ontdekt dat Durant nog steeds in leven is. Als snel pakt hij zijn criminele handeltje weer op. Hij bevrijdt een gestoorde wetenschapper uit een inrichting en dwingt hem om een levensgevaarlijk wapen te ontwikkelen. Nu Darkman al weer verbeteringen heeft aangebracht aan zijn experiment met synthetische huid gaat hij opnieuw de strijd aan met Durant om hem voor altijd uit te schakelen.
Op zijn waarschijnlijk laatste missie wordt Thomas Beckett naar een arm, door oorlog geteisterd land in Oost-Europa gestuurd om de leider te vermoorden. Als de missie is geslaagd, moeten Beckett en zijn spotter nog levend weg zien te komen. Hiervoor moeten ze door verwoeste steden en verlaten landschappen vluchten terwijl ze achtervolgd worden door huurmoordenaars.