Batou is een levende cyborg wiens lichaam volledig door mensen werd gemaakt. Het enige 'menselijke' aan hem is zijn brein, waarin de herinneringen sluimeren van een vorig leven.
Enkele jaren na de gebeurtenissen uit de eerste film is het Jaegerprogramma ten prooi gevallen aan corruptie en zijn de massavernietigingswapens in verkeerde handen gevallen. De machine Gipsy Avenger is hiervan een voorbeeld.
Helikopterpiloot Adam Gibson overleeft door een plaatsverwisseling met een vriend een aanslag op z'n leven, en keert naar huis. Daar aangekomen ontdekt hij dat z'n leven is overgenomen door een identieke kloon van hemzelf.
Een monsterachtige moordenaar terroriseert Londen met een serie gruwelijke moorden. Stone (Rutger Hauer) is een ervaren, geharde en meedogenloze Amerikaanse huurling. Bijgestaan door de jonge detective Durkin staat hij voor de taak het monster, dat ook zijn partner heeft vermoord, te vernietigen. Het lijkt een onmogelijke taak die hem op het randje van gezond verstand èn van de dood zal laten balanceren.
Tijdens het kritische experiment dat David Banner van de Hulk zou verlossen, saboteert een spion het laboratorium. Banner wordt verliefd op de spion, Jasmin, die alleen missies uitvoert omdat haar zus wordt gegijzeld door Jasmins superieuren. Banner en Jasmin proberen te ontsnappen aan de vijandelijke agenten om samen hun leven weer op te bouwen, maar de Hulk is nooit ver van hen verwijderd.
200 jaar in de toekomst krijgt een Martiaanse politie-eenheid de opdracht om een gevaarlijke gevangene van een mijnwerkers-plaats naar de gevangenis te brengen. Wanneer het team daar aankomt is het plaatsje echter uitgestorven, en zijn sommige inwoners bezeten door de voormalige bewoners van de planeet.
Het experiment van een wetenschapper zou kunnen leiden tot het eerste door de mens gemaakte, functionerende, levende organisme. Een elite ontsnappingskunstenaar-privédetective probeert hem tegen te houden.