Sæt sejl og tag med på en rejse med masser af sjov og vildt morsomme sørøverkrumsping sammen med den største flok kiksede sørøvere der nogensinde har besejlet de syv verdenshave! Da den berygtede Piratkaptajn (Gordon Kennedy) atter en gang bliver sejlet agterud af sine rivaler Black Bellamy og Nådesløse Liz, sætter han kursen mod den eftertragtede pris som Årets Pirat. Med sin trofaste dronte Polly og sin brogede besætning ved sin side kommer Piratkaptajnen til at kæmpe mod en pirathadende dronning og redde en ung videnskabsmand, men de glemmer ikke for et øjeblik dét, alle sørevere elsker mest: eventyr!

Verdens undergang er nær, og nogen har bygget en ark til alle dyrene, så de kan overleve flodbølgen. De to nestrianerdyr Dan og Fini får dog ikke plads om bord, men takket være grympdyrene Hanne og Lea lykkes det dem at komme med alligevel. Desværre falder ungerne, Fini og Lea, overbord, og deres respektive forældre, Dan og Hanne, må finde en måde at vende arken på, så de kan redde børnene.