Star-Lord, encara recuperant-se de la pèrdua de Gamora, ha de reunir el seu equip per defensar l'univers juntament amb la protecció d'un dels seus. Una missió que, si no es completa, podria portar al final dels Guardians tal com els coneixem.

Quan a la tripulació de la nau Enterprise li ordenen que torni a casa, a la Terra s'enfronten a una terrorífica força que, aparentment des de dins, ha perpetrat un atac a la cúpula de la Federació i tot el que aquesta representa. Per intentar solucionar el problema, i amb un assumpte personal que resoldre, el capità Kirk encapçala una incursió a un planeta en guerra on la lleialtat es veurà posada a prova, les amistats es trencaran, i caldrà fer certs sacrificis per l'única família que li queda a Kirk: la seva tripulació .

Quins esdeveniments històrics van conduir a la Batalla d'Axanar? Com va aconseguir la Federació contrarestar el totpoderós Imperi Klingon? Aquestes i moltes altres preguntes són respostes pels principals protagonistes de la conflagració, des de Kharn, el temible comandant suprem dels klingons, fins a l'almirall Ramírez, l'introductor dels nous creuers de combat a la Flota Estel·lar.

Els rebels es preparen per lluitar contra les implacables forces de Món Mare mentre es forgen vincles infrangibles, sorgeixen nous herois i neixen les llegendes.