El FBI cerca a un assassí en sèrie, dit Buffalo Bill, que mata a les seves víctimes, totes elles adolescents, després de preparar-les minuciosament i arrencar-los la pell. Per poder atrapar-lo contacten amb Clarice Starling, una brillant llicenciada universitària, experta en conductes psicòpates, que aspira a formar part del FBI. Seguint les instruccions del seu cap, Jack Crawford, Clarice visita la presó d'alta seguretat on el govern manté tancat a Hanibal Lecter, antic psicoanalista i assassí, dotat d'una intel·ligència superior a la normal. La seva missió serà intentar treure-li informació sobre els patrons de conducta de "Buffalo Bill".
Suècia, mitjans del segle XIV. La Peste Negra assola Europa. Després de deu anys d'inútils combats a les Croades, el cavaller suec Antonius Blovk i el seu lleial escuder tornen de Terra Santa. Blovk és un home turmentat i ple de dubtes. Pel camí es troba amb la Mort que ho reclama. Aleshores ell li proposa jugar una partida d'escacs, amb l'esperança d'obtenir d'Ella respostes a les grans qüestions de la vida: la mort i l'existència de Déu.
Després d'obtenir un èxit rotund, un director de cinema travessa una crisi de creativitat i intenta inútilment fer una nova pel·lícula. En aquesta situació, comença a passar revista als fets més importants de la seva vida ia recordar totes les dones que ha estimat.
Las Vegas, 1973. Sam "Ace" Rothstein, un professional de les apostes, és l'eficaç director d'un important casino que pertany a un grup de mafiosos. La seva missió és controlar el funcionament del negoci i garantir que el corrent de diners que pararà a les mans dels seus caps segueixi fluint. Las Vegas és un lloc ideal per a milionaris i polítics, però és també lloc de pas de tafurs, prestadors, traficants de drogues i matons. Un dia el violent Nicky Santoro, a qui els seus caps han encarregat que tingui cura de Sam, arriba a Las Vegas amb la intenció de quedar-s'hi.
En Charlie Babbitt dirigeix una empresa de venda de cotxes esportius, que està en situació de fallida. Va a l'enterrament del seu pare i s'assabenta que només li ha deixat d'herència un cotxe, mentre que tota la fortuna ha anat a parar a en Raymond, el germà gran que en Charlie ignorava que existís. En Raymond és un autista dotat d'una extraordinària memòria, especialment per als números. En Charlie s'emporta en Raymond de la institució on viu amb la intenció de fer valer els seus drets. Durant un llarg periple, en Charlie passarà de la irritació a l'afecte per al seu germà, indefens davant del menor problema.
La pel·lícula consta de nou trames paral·leles que tenen lloc a la Vall de San Fernando, a Los Angeles: un nen prodigi, el presentador d'un concurs de televisió, un exnen prodigi, un moribund, el seu fill perdut, la dona i el infermer del moribund. Són històries aparentment independents, però que guarden entre si una relació estranya. Magnolia és el retrat de la vida americana vist a través d'una sèrie de vinyetes còmiques i commovedores.
Un home captiu dels seus propis somnis tracta de despertar-se i prendre el control de la seva pròpia imaginació. La vida sembla estar millorant per al tímid i introvertit Stephane quan la seva mare el convenç perquè torni a la casa on va créixer a França, prometent-li un treball. La seva naturalesa creativa i el seu pertorbador món de somnis amenacen constantment amb usurpar el seu món real.
Una adolescent passa uns dies de vacances a la platja amb els seus pares, que l’únic que fan és beure, dormir i discutir. Una nit, avorrida de la situació, se’n va amb el seu germà a una discoteca i comença a flirtejar amb homes madurs, prenent consciència de la fascinació que genera el seu cos. Un relat àcid i desencantat d’iniciació sexual femenina.