menceritakan tentang keluarga Madrigals, sebuah keluarga yang tinggal di rumah ajaib dan masing-masing anggota keluarga memiliki keajaibannya tersendiri. Pada jaman dahulu kala, Abuela bersama suami dan anak-anaknya melarikan diri dari kerusuhan di desa.

Alex si singa adalah raja hutan kota, atraksi utama di Kebun Binatang Central Park, New York. Ia dan sahabat-sahabatnya—Marty si zebra, Melman si jerapah, dan Gloria si kuda nil—telah menghabiskan seluruh hidup mereka dalam kurungan yang menyenangkan di hadapan publik yang mengagumi dan dengan makanan yang disediakan secara teratur bagi mereka. Tidak puas untuk membiarkannya begitu saja, Marty membiarkan rasa ingin tahunya menguasainya dan melarikan diri—dengan bantuan beberapa penguin yang luar biasa—untuk menjelajahi dunia.

Jaime Reyes yang baru saja lulus kuliah pulang ke rumah dengan harapan tinggi akan masa depannya, hanya untuk mendapati bahwa rumahnya tidak sama seperti sebelumnnya. Saat dia mencari tujuannya didunia, takdir mendatangi Jaime ketika mendapati dirinya di kontrol oleh peninggalan kuno bioteknologi alien yang disebut "The Scarab".