Alex si singa adalah raja hutan kota, atraksi utama di Kebun Binatang Central Park, New York. Ia dan sahabat-sahabatnya—Marty si zebra, Melman si jerapah, dan Gloria si kuda nil—telah menghabiskan seluruh hidup mereka dalam kurungan yang menyenangkan di hadapan publik yang mengagumi dan dengan makanan yang disediakan secara teratur bagi mereka. Tidak puas untuk membiarkannya begitu saja, Marty membiarkan rasa ingin tahunya menguasainya dan melarikan diri—dengan bantuan beberapa penguin yang luar biasa—untuk menjelajahi dunia.

Setelah pindah ke Spiderwick Estate yang kumuh bersama ibu mereka, saudara kembar Jared dan Simon Grace, beserta saudara perempuan mereka Mallory, mendapati diri mereka tertarik ke dunia alternatif yang penuh dengan peri dan makhluk lainnya.