Het is 1930. Het is de tijd van lucht-piraten, premiejagers en allerlei ander soort piloten. De sluwste en beste van alle piloten is Porco Rosso. Porco Rosso is een man met het hoofd van een varken. Hij verdient zijn brood door middel van baantjes zoals mensen redden van piraten.

In de niet zo verre toekomst en beïnvloed door de ’Robot Ethics Committee’ wordt het gebruik van androids gemeengoed. Deze worden door de mensen gezien als gebruiksvoorwerpen. Slechts enkelen kunnen begrip opbrengen voor hen vanwege hun menselijke voorkomen. Bekend onder de naam ’android-holics’, zijn zij een sociaal probleem geworden en dat wordt alleen maar erger wanneer sommige androids echte mensen willen worden.

Na het incident in de Zuidoost-Aziatische Unie in 2116 hervat Shinya Kogami zijn zwervende reis. In een klein Zuid-Aziatisch land redt Kogami een bus met vluchtelingen die wordt aangevallen door gewapende guerrillastrijders. Onder de vluchtelingen bevindt zich een jongedame met de naam Tenzin, die Kogami smeekt haar te leren hoe ze wraak kan nemen op de vijand. Wat zien het meisje dat wraak wenst en de man die wraak heeft geëist, precies als ze staren naar de rand van een wereld waaruit geen ontsnapping mogelijk is?

2112; de zomer voordat Akane Tsunemori werd toegewezen aan Divisie Eén van de afdeling Recherche van het Openbaar Veiligheidsbureau. Teppei Sugo, een ervaren piloot van de 15e Integrated Task Force van het Defensieleger, sluit zich aan bij de militaire operatie in Okinawa. Drie maanden later opent een onbemande gevechtsdrone het vuur op het Ministerie van Defensie in Tokio. Handhaver Tomomi Masaoka van CID Division One wordt naar de militaire basis van Sugo gestuurd om de waarheid achter deze zaak te onderzoeken.

Een oude voorspelling komt uit als de Pokémon Articuno, Zapdos en Moltres na eeuwen van harmonie worden verstoord. De natuurelementen raken uit hun evenwicht en het leven op aarde hangt af van de onwaarschijnlijke samenwerking tussen de mythische Pokémon Lugia en een mysterieuze 'uitverkorene' waarvan in de legende sprake is.

Officier Deunan Knute en zijn cyborg-partner Briaros Hecatonchires krijgen de opdracht om de Olympus City Computer te beschermen tegen een terroristische aanval. Bij een eventuele aanslag op de computer zou namelijk de hele stad platgelegd kunnen worden en zou er massale chaos kunnen ontstaan.

Tijdens een middagje vissen ontdekken Fly, Stella en Chuck het mysterieuze laboratorium van de zonderlinge professor Makreel. De professor heeft een toverdrank uitgevonden, waardoor mensen onder water kunnen leven. Fly´s zusje Stella drinkt per ongeluk van het drankje, verandert in een zeester en verdwijnt in de golven. De twee jongens nemen ieder ook een slok en gaan achter Stella aan; Fly als vis en Chuck als kwal. Als ze het tegengif niet binnen 48 uur vinden, zullen ze voor altijd een vis blijven. Het tegengif is in handen gevallen van de kwade vis Joe, die belust is op meer macht. Het tegengif maakt vissen namelijk intelligent. Joe´s nieuw verworven gave stelt hem in staat om heer en meester van de onderwaterwereld te worden. Met hulp van Haai, zijn bodyguard, onderwerpt hij heel het vissenvolk aan zijn bewind. Stella´s nieuwe vriendje, het zeepaardje Sasha, sluit zich bij het drietal aan.

De Minerva meert aan bij een ZAFT-basis, waar ze worden opgewacht door voorzitter Durandal. Tijdens een rustig diner praat hij met Athrun, Shinn en andere leden van de bemanning. Dit gesprek brengt Shinn ertoe na te denken over het verleden en de gebeurtenissen die hen hebben gebracht waar ze nu zijn. Maar begrip brengt geen vrede, en na nog een ruzie met enkele van zijn scheepsmaten gaat Shinn aan land om zijn hoofd leeg te maken. Daar ontmoet hij een mooi meisje en ziet haar in de oceaan vallen. Hij duikt erin om haar te redden, en moet op zijn beurt wachten om gered te worden. Ondertussen verzamelen de Alliantietroepen zich, samen met hun Orb-bondgenoten, om een ​​aanval op ZAFT te lanceren. De Minerva bereidt zich voor op de strijd. Maar onbekend aan beide kanten, ver onder de golven, gaat een andere groep proberen een einde te maken aan de gevechten.

Misty, Brock, Ash en Pikachu moeten samen met hun nieuwe vriendje Celebi strijden tegen een gevaarlijke Pokémon jager. Als Celebi gevangen wordt, doen zijn vriendjes alles om hem te bevrijden en het bos te redden. Zelfs de hulp van Ash, de beste Pokémon meester aller tijden, wordt ingeroepen.

Het jaar is Kosmisch Tijdperk 73. De Bloedige Valentijnsoorlog, uitgevochten tussen de PLANTS ruimtekolonies en de naties van de Atlantische Federatie, is geëindigd en er is een ongemakkelijke wapenstilstand op aarde ontstaan. Met de ondertekening van het Junius Zeven-verdrag hebben de soldaten van de wereld het slagveld en de gruwelijke aanblik van de oorlog achter zich gelaten. Velen die hebben gevochten zoeken nu vrede en toevlucht in de beschutting van het burgerleven. Maar één jongen, Shin Asuka, vindt dat ongelooflijk moeilijk. Als coördinator die zijn hele familie verloor tijdens de Slag om Orb, vecht hij nu met ZAFT in een van hun nieuwste machines, de Impulse Gundam. Natuurlijk ontwikkelt ZAFT deze machines alleen voor defensieve toepassingen - dat beweren ze tenminste - maar wanneer een groep Federatie-agenten enkele van deze prototypemachines steelt, wordt de wereld opnieuw in de richting van oorlog gestort.

Nadat hij Logos en de Earth Alliance heeft verslagen, onthult de triomfantelijke voorzitter Durandal nu zijn ultieme plan voor de mensheid. De wereld reageert met verwarring en afgrijzen op de details van het Destiny Plan, maar Durandal is te ver gekomen om iemand zijn droom van eeuwige vrede en geluk in de weg te laten staan. Met behulp van de wapens van zijn gevallen vijanden laat de voorzitter zien dat hij voor niets zal stoppen om zijn nieuwe wereld te creëren. De Aartsengel en zijn bondgenoten zijn nu de laatste hoop van de mensheid om Durandal ervan te weerhouden zijn plannen uit te voeren. Opnieuw begint een hevig gevecht rond het Requiem-kanon en zijn relaisstations, en de Gundam-piloten ontmoeten elkaar in een laatste confrontatie boven het maanoppervlak. Shinn tegen Athrun, Kira tegen Rey, Aartsengel tegen Minerva... Uiteindelijk kan er maar één overwinnaar zijn.

De vloten van de Earth Alliance en de Orb Union verzamelen hun krachten in de Middellandse Zee en lanceren een tweede aanval op de Minerva, en deze keer kan zelfs de tussenkomst van de Aartsengel de gevechten niet stoppen. Terwijl Shinn zijn woede loslaat op de Orb-vloot, gaan Kira en Athrun de confrontatie met elkaar aan in de strijd, en een van deze levenslange vrienden wordt verslagen. Terug in het PLANT-thuisland denkt voorzitter Durandal terug aan zijn verleden en overweegt hij zijn plannen voor de toekomst... plannen die de verwijdering van verstorende elementen zoals Lacus en de Archangel-bemanning vereisen. In de nasleep van de strijd komt Shinn tot een noodlottige beslissing. Stella, de vijandelijke piloot die hij ooit beloofde te beschermen, zit nu gevangen aan boord van de Minerva. Stella's fysieke toestand gaat snel achteruit en Shinn zal alles waarin hij gelooft moeten verraden om haar leven te redden.