De huurmoordenaar 'The Bride' wordt op haar eigen bruiloft neergeschoten door haar opdrachtgever Bill en zijn handlangers. Ze overleeft de aanslag, maar door een kogel in haar hoofd ligt ze vier jaar in coma.
De film Brother laat de kijker geloven dat de grootste criminelen mensen met de beste manieren kunnen zijn, oftewel gangsters met respect. Yamamoto (Takeshi Kitano) wordt verstoten door zijn Japanse maatjes en gaat in Los Angeles op zoek naar zijn halfbroer. Deze blijkt zich in een onbeduidende ‘gang’ te bewegen van kleine drugshandelaren. Yamamoto ontfermt zich over deze groep en leert hun de kneepjes van het vak, zoals hij deze in Japan heeft opgedaan. Zijn input is zo succesvol dat het vooralsnog onbekende criminele groepje uitgroeit tot een ware criminele organisatie die de straten van Los Angeles domineert. Vol respect voor autoriteiten en elkaar distantiëren zij zich van de typische Amerikaanse gangsters. Maar criminelen zullen zij altijd blijven.
Op maandagochtend wordt een Japanse kantoorklerk wakker in een hotelkamer, zonder zich iets van het weekend te herinneren. Maar het moet heftig zijn geweest, want als hij de televisie aanzet ziet hij op het nieuws hoe de politie hem buiten opwacht.
Een yakuza slaat op de vlucht nadat hij de leider van zijn bende heeft verraden. Hij vlucht naar Taipei, waar hij meteen een nieuw baantje aanneemt en probeert een zo onopvallend mogelijk leven te leiden.
Nadat Kunisada's Yakuza-leider en vaderfiguur op brute wijze is vermoord, gaan hij en zijn beste vriend op een missie om zijn dood te wreken, waarbij hij andere Yakuza-leiders vermoordt, wat leidt tot een laatste confrontatie tussen de moordenaars van de oude man.
Nadat de onbeschofte rechercheur Hubert onbedoeld de zoon van zijn baas een klap in het gezicht heeft gegeven, krijgt hij van de commissaris het advies een korte vakantie te nemen. Hubert accepteert dit met tegenzin en besluit dan ook wat meer tijd voor zichzelf te nemen. Dan krijgt hij een bizat telefoontje uit het Japan. Een notaris vertelt hem dat Miko, de liefde van zijn leven die hij al meer dan 20 jaar niet heeft gezien, onder vreemde omstandigheden is gestorven. Zij is hem echter niet vergeten, want hij blijkt haar wettige erfgenaam te zijn. Wat zij hem heeft nagelaten is meer dan een testament, meer dan een cadeau, meer dan zo maar een probleem... Het is Yumi Yoshimodo, zijn zeer recalcitrante dochter. Samen met zijn oud-collega Momo zet hij Tokyo op z'n kop om Yumi uit de meest benarde situaties te redden.
Special-agent Nick Davis weet op slinkse wijze toe te treden tot de beruchte Yakuza, een Japanse geheime organisatie. Zijn opdracht is om geheimen te ontfutselen, maar hij raakt ondertussen steeds meer betrokken bij het mysterieuze en keiharde wereldje. Daarbij wordt hij verliefd op Yuko, de kleindochter van de grote baas Sawamoto, waardoor zijn gedrag behoorlijk wordt beïnvloed. Nick zit gevangen tussen twee werelden, maar moet een keuze maken. Een leven vol liefde en saamhorigheid of het politieleven waarvoor hij een eed heeft afgelegd.