Hedwig is in Oost-Berlijn geboren als de jongen Hansel. Hij werd verliefd op een Amerikaanse soldaat, en onderging een sex-operatie om met hem te kunnen trouwen en naar het westen te vluchten. Helaas is het niet helemaal naar wens verlopen: jaren later tourt Hedwig met haar rockband door de States, en vertelt ze haar levensverhaal tussen de concerten door.

De film vertelt het verhaal van Harvey Milk (Sean Penn). Harvey Milk was het eerste homoseksuele gemeenteraadslid van San Francisco en was één van de allereerste activisten voor gelijke rechten. Milk leert in deze periode onder andere de activisten Cleve Jones (Emile Hirsch) en Scott Smith (James Franco) kennen waarmee hij verschillende mooie, maar ook dramatische momenten beleeft.

Een kijkje achter de schermen van de historische zaak in Californië om het verbod op homohuwelijken aan de kaak te stellen. De rechtszaak haalt alle kranten wanneer het onwaarschijnlijke duo Ted Olson en David Boies tegenover elkaar komt te staan als advocaten.

In de herfst van 1953 trekt de ambitieuze lerares Katherine Watson naar het Wellesley College, één van de meest prestigieuze meisjesscholen van de Verenigde Staten. Ze zal er kunstgeschiedenis gaan doceren. De aanpassing aan haar nieuwe omgeving verloopt echter moeizaam. Haar liefde voor moderne kunst en haar uitgesproken mening over de rol van de vrouw in de samenleving worden allesbehalve gewaardeerd door haar conservatieve collega's.

Archiefbeelden uit 2006 - 2010 van een jong meisje dat opgroeit in de leeftijd van vier tot acht jaar. Er bestaan ​​slechts fragmenten van wat men zich herinnert. Woorden van een transgenderman komen naar de oppervlakte terwijl vluchtige herinneringen voortduren.