Een entomoloog bezoekt een afgelegen gebied van Japan om de plaatselijke insecten te bestuderen. Wanneer hij de laatste bus naar Tokio mist, oppert de plaatselijke bevolking dat hij kan overnachten bij een vrouw die in een huisje in de zandkuil woont.
Als Zatôichi, een rondreizende masseur en groot samoerai, een door criminelen gerund dorpje binnentrekt, weerhoudt het feit dat hij blind is hem er niet van het aan de stok te krijgen met de lokale bende.
Een jaar na de gebeurtenissen uit het eerste deel keert Zatoichi terug naar het dorp Iioka om in de tempel te bidden voor de ronin Hirate Miki, die hij heeft vermoord. Maar de handlangers van een hooggeplaatste heer, die Zatoichi eerder had gemasseerd en zijn mentale handicap had ontdekt, zitten hem op de hielen. Om deze gênante onthulling te verdoezelen, huren de samurai Yakuza-baas Kanbei in om Zatoichi voor altijd het zwijgen op te leggen. Tot overmaat van ramp is Zatoichi's eigen broer Yoshiro ook in het dorp, op zoek naar Ichi. Zatoichi heeft ooit zijn eigen broer kreupel gemaakt in een geschil over een vrouw.
Een beginnende huurmoordenaar, die financieel in de problemen zit, neemt met tegenzin de taak op zich om de geplande moordenaar van een Japanse tycoon te vinden.
Kim In-nam is een huurmoordenaar die net zijn laatste klus afgerond heeft; hij heeft de Japanse gangster Koraeda uit de weg geruimd. Hij gaat vervolgens naar Thailand, om een ontvoeringszaak die aan hem gelinkt is, op te lossen. Daar ontmoet hij Yoo-Yi, die hem gaat helpen bij deze zaak. Opeens wordt Kim In-nam opgejaagd door een man die hij uit een verleden kent...
In een stadsdeel van Los Angeles, genaamd 'Little Tokyo', zwaait de keiharde Yakuza baas, Funekei Yoshida de scepter. Hij is meedogenloos voor mensen zijn die niet naar hem willen luisteren. Zijn wil is wet. De undercover politiemannen Chris Kenner en Johnny Murata willen een einde maken aan Funekei's schrikbewind. Beide zijn gespecialiseerd in de oosterse vechtkunst, de Japanse taal en gewoontes. Toch blijft het een levensgevaarlijke klus die ze moeten klaren.
Ryuichi is een gangster die gedreven wordt door zijn verlangen naar macht en de herinneringen aan zijn ontnomen kinderjaren. Zijn jongere broer Toji is net teruggekeerd van zijn opleiding in Amerika. Samen zullen ze de ruwe levenslessen van het gangsterbestaan ondervinden. Ondertussen ziet detective Jojima zich steeds meer het Yakuza-wereldje ingetrokken worden doordat hij zich meer en meer in maffiapraktijken mengt om geld bij elkaar te sprokkelen voor een levensreddende operatie voor zijn dochter...
Een jonge man genaamd Tatsumi Karasawa duikt plotseling op in de criminele wereld van Shinjuku, Tokio, en wordt de leider van een groep amateurs die geen enkele aarzeling tonen om zowel de politie als bendes onder ogen te zien. Zijn successen in de underground van Tokio zorgen ervoor dat een chef en een yakuza-baas een samenzwering beramen om hem te elimineren.